Una firma vírica-bacteriana integradora basada en la carga viral y el perfilado del microbioma de alta resolución...

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• Enfermedades Infecciosas
• Biología Computacional

Sus antecedentes:

• El papel de la microbiota nasofaríngea (FN) en la infección por SARS-CoV-2 y la predicción de resultados de COVID-19 requiere una mayor definición.
• La investigación del potencial de la microbiota nasofaríngea en la modulación de las respuestas inmunitarias del huésped durante la infección por SARS-CoV-2 es crucial.

Objetivo del estudio:

• Determinar si la integración de perfiles microbianos nasofaríngeos con datos virológicos y clínicos puede mejorar la predicción de mortalidad en pacientes con COVID-19.
• Desarrollar un marco sólido para predecir la mortalidad por COVID-19 utilizando un enfoque multiómico.

Principales métodos:

• Análisis de hisopos nasofaríngeos de 81 pacientes con COVID-19 y 70 controles mediante secuenciación del ARNr 16S para el perfilado del microbioma.
• Desarrollo de modelos de aprendizaje automático que integran taxones microbianos, carga viral y metadatos clínicos para la predicción de mortalidad.

Principales resultados:

• La carga viral elevada fue el predictor independiente más fuerte de mortalidad (OR: 3,80).
• La infección por SARS-CoV-2 redujo significativamente la uniformidad de la comunidad microbiana.
• Un modelo integrado de aprendizaje automático (carga viral, edad, taxones microbianos) logró una alta precisión predictiva de mortalidad (AUC = 0,9046), superando a los datos clínicos por sí solos.

Conclusiones:

• Un enfoque integrador que combina la microbiota nasofaríngea y la carga viral proporciona un marco sólido para predecir la mortalidad por COVID-19.
• Esta estrategia presenta una herramienta prometedora y no invasiva para mejorar la estratificación clínica del riesgo en pacientes con COVID-19.