Datos de ARN-seq del virus de la viruela del mono (MPXV) que proporcionan evidencia de protección de los transcritos...

Área de la Ciencia:

• Virología
• Biología Molecular
• Genética

Sus antecedentes:

• El brote de 2022 del virus de la viruela del mono (MPXV) exhibió una alta tasa de mutación, particularmente sustituciones C→T y G→A.
• Estas mutaciones son consistentes con la actividad de la desaminasa de citidina APOBEC3, que se sabe que afecta al ADN.
• El impacto de APOBEC3 en los transcritos de ARN del MPXV no estaba claro previamente.

Objetivo del estudio:

• Investigar si las enzimas APOBEC3 editan activamente los transcritos de ARN del MPXV.
• Diferenciar entre la edición de ARN y la mutagenia a nivel de ADN como la fuente de las sustituciones observadas.

Principales métodos:

• Análisis de datos de secuenciación de ARN (ARN-seq) de muestras infectadas con MPXV.
• Examen de los patrones de sustitución, incluidas las mutaciones G→A y su distribución.
• Evaluación del impacto de las sustituciones en las secuencias que codifican proteínas y la correlación con las características transcripcionales.

Principales resultados:

• Se observó un enriquecimiento de sustituciones de la firma APOBEC en los datos de secuenciación de ARN del virus de la viruela del mono (MPXV).
• La evidencia apoya sólidamente la mutagenia a nivel de ADN sobre la edición de ARN, incluido un número significativo de sustituciones G→A.
• Las sustituciones tuvieron un efecto en gran medida neutral en las secuencias de proteínas y carecieron de correlación con las estructuras secundarias del ARN o los puntos calientes transcripcionales.

Conclusiones:

• APOBEC3A o APOBEC3B probablemente impulsaron la mutagenia a nivel de ADN observada en el MPXV.
• Los cambios aparentes similares a APOBEC en el ARN se atribuyen a mutaciones fijas de ADN, no a la edición activa de ARN.
• El papel de APOBEC3 en la configuración de la evolución del MPXV ocurre principalmente a nivel de ADN.