Análisis transcriptómico integrado de células únicas y a granel revela patogénesis compartida y biomarcadores...

Área de la Ciencia:

• Oncología
• Bioinformática
• Biología Molecular

Sus antecedentes:

• El cáncer de mama (CM) y el cáncer de tiroides (CT) son neoplasias malignas reguladas hormonalmente con una comorbilidad creciente.
• Los mecanismos moleculares que subyacen a su coexistencia no se comprenden bien.

Objetivo del estudio:

• Elucidar la patogénesis compartida entre el CM y el CT.
• Identificar biomarcadores pronósticos y dianas terapéuticas comunes para ambos cánceres.

Principales métodos:

• Análisis bioinformático integrador de datos de secuenciación de ARN de células únicas y a granel.
• Se realizaron análisis de enriquecimiento funcional, transcriptoma de células únicas, VCN, NMF y WGCNA.
• Construcción de firmas pronósticas utilizando aprendizaje automático y ensayos funcionales para la validación.

Principales resultados:

• La vía de señalización JAK-STAT y la interacción del receptor de citoquinas-citoquinas se identificaron como mecanismos patogénicos compartidos.
• Los módulos clave de expresión génica (MP2, MP4, MP5) y las poblaciones celulares (fibroblastos SFRP2+, células mieloides HLA_DPB1+) fueron críticos en ambos cánceres.
• SMR3B validado como un gen pronóstico compartido que influye en la proliferación, migración e invasión.

Conclusiones:

• Perspectivas integrales sobre los mecanismos moleculares compartidos del CM y el CT.
• SMR3B es un biomarcador pronóstico prometedor y una diana terapéutica para pacientes con riesgo dual.