Jove
Visualize
Contáctanos

Videos de Conceptos Relacionados

Protein and Protein Structure02:15

Protein and Protein Structure

87.5K
Proteins are one of the most abundant organic molecules in living systems and have the most diverse range of functions of all macromolecules. Proteins may be structural, regulatory, contractile, or protective. They may serve in transport, storage, or membranes; or they may be toxins or enzymes. Their structures, like their functions, vary greatly. They are all, however, amino acid polymers arranged in a linear sequence.
A protein's shape is critical to its function. For example, an enzyme...
87.5K
Structural Protein Function01:56

Structural Protein Function

29.9K
Structural proteins are a category of proteins responsible for functions ranging from cell shape and movement to providing support to major structures such as bones, cartilage, hair, and muscles. This group includes proteins such as collagen, actin, myosin, and keratin.
Collagen, the most abundant protein in mammals, is found throughout the body. In connective tissue, such as skin, ligaments, and tendons, it provides tensile strength and elasticity.  In bones and teeth, it mineralizes to...
29.9K
Structural Protein Function01:56

Structural Protein Function

3.3K
3.3K
Protein and Protein Structures02:15

Protein and Protein Structures

19.1K
19.1K
pH Scale02:41

pH Scale

79.7K
Hydronium and hydroxide ions are present both in pure water and in all aqueous solutions, and their concentrations are inversely proportional as determined by the ion product of water (Kw). The concentrations of these ions in a solution are often critical determinants of the solution’s properties and the chemical behaviors of its other solutes. Two different solutions can differ in their hydronium or hydroxide ion concentrations by a million, billion, or even trillion times. A common means of...
79.7K
Multiple Allele Traits01:49

Multiple Allele Traits

38.1K
The Concept of Multiple Allelism
38.1K

También podría leer

Artículos Relacionados

Artículos vinculados a este trabajo por autores compartidos, revista y gráfico de citas.

Ordenar por
Same author

Metabologenomic profiling of the endemic Australian fungus <i>Aspergillus luteorubrus</i>.

Mycology·2026
Same author

Structural motif search across the protein universe with Folddisco.

Nature biotechnology·2026
Same author

A novel method to select Reference Proteomes in UniProt.

bioRxiv : the preprint server for biology·2026
Same author

Simple and Thorough Detection of Related Sequences with Position-Varying Probabilities of Substitutions, Insertions, and Deletions.

Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology·2026
Same author

Protein structure-informed bacteriophage genome annotation with Phold.

Nucleic acids research·2026
Same author

AlphaFold Protein Structure Database 2025: a redesigned interface and updated structural coverage.

Nucleic acids research·2025
Same journal

A native sulfur deposit in Gale crater, Mars.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Coordinated demise of harmful algal blooms.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Genetic effects put into context.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Bacteria share proteins to survive antibiotics.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Impacts shaped Earth's first continents.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Erratum for the Report "Covalently bonded single-molecule junctions with stable and reversible photoswitched conductivity" by C. Jia <i>et al</i>.

Science (New York, N.Y.)·2026
Ver todos los artículos relacionados
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
ACERCA DE JoVE
Visión GeneralLiderazgoBlogCentro de Ayuda JoVE
AUTORES
Proceso de PublicaciónConsejo EditorialAlcance y PolíticasRevisión por ParesPreguntas FrecuentesEnviar
BIBLIOTECARIOS
TestimoniosSuscripcionesAccesoRecursosConsejo Asesor de BibliotecasPreguntas Frecuentes
INVESTIGACIÓN
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of ExperimentsArchivo
EDUCACIÓN
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab ManualCentro de Recursos para ProfesoresSitio de Profesores
Términos y Condiciones de Uso
Política de Privacidad
Políticas

Video Experimental Relacionado

Updated: Jan 31, 2026

A Protocol for Computer-Based Protein Structure and Function Prediction
16:41

A Protocol for Computer-Based Protein Structure and Function Prediction

Published on: November 3, 2011

69.8K

Alineación de múltiples estructuras de proteínas a escala con FoldMason.

Cameron L M Gilchrist1,2, Milot Mirdita1, Martin Steinegger1,3,4,5

  • 1School of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea.

Science (New York, N.Y.)
|January 29, 2026
PubMed
Resumen
Este resumen es generado por máquina.

FoldMason es una nueva herramienta computacional para alinear estructuras de proteínas, permitiendo un análisis más rápido y preciso de proteínas distantes. Este avance ayuda a comprender la evolución y función de las proteínas, incluso con datos de secuencia limitados.

Más Videos Relacionados

Structure-Based Simulation and Sampling of Transcription Factor Protein Movements along DNA from Atomic-Scale Stepping to Coarse-Grained Diffusion
09:17

Structure-Based Simulation and Sampling of Transcription Factor Protein Movements along DNA from Atomic-Scale Stepping to Coarse-Grained Diffusion

Published on: March 1, 2022

3.6K
Structure Solution of the Fluorescent Protein Cerulean Using MeshAndCollect
06:42

Structure Solution of the Fluorescent Protein Cerulean Using MeshAndCollect

Published on: March 19, 2019

6.2K

Videos de Experimentos Relacionados

Last Updated: Jan 31, 2026

A Protocol for Computer-Based Protein Structure and Function Prediction
16:41

A Protocol for Computer-Based Protein Structure and Function Prediction

Published on: November 3, 2011

69.8K
Structure-Based Simulation and Sampling of Transcription Factor Protein Movements along DNA from Atomic-Scale Stepping to Coarse-Grained Diffusion
09:17

Structure-Based Simulation and Sampling of Transcription Factor Protein Movements along DNA from Atomic-Scale Stepping to Coarse-Grained Diffusion

Published on: March 1, 2022

3.6K
Structure Solution of the Fluorescent Protein Cerulean Using MeshAndCollect
06:42

Structure Solution of the Fluorescent Protein Cerulean Using MeshAndCollect

Published on: March 19, 2019

6.2K

Área de la Ciencia:

  • La bioinformática estructural es una bioinformática estructural.
  • Biología computacional Biología computacional.
  • Análisis de la estructura de las proteínas Análisis de la estructura de las proteínas

Sus antecedentes:

  • La conservación de la estructura de la proteína se extiende más allá de la secuencia, lo que requiere una alineación estructural múltiple (MSTA) para analizar proteínas distantemente relacionadas.
  • Los avances en la predicción computacional de la estructura de las proteínas generan vastos conjuntos de datos, que exigen métodos MSTA eficientes y precisos.

Objetivo del estudio:

  • Introducir FoldMason, un nuevo método MSTA progresivo diseñado para el análisis de alto rendimiento de grandes conjuntos de datos de estructura de proteínas.
  • Para evaluar la velocidad y la precisión de FoldMason en comparación con los métodos MSTA de última generación existentes.

Principales métodos:

  • FoldMason emplea una estrategia de alineación progresiva, utilizando en pares los alineadores estructurales Foldseek y TM-align.
  • El método se probó en conjuntos de datos a gran escala, incluidas las glicoproteínas Flaviviridae, para evaluar su rendimiento.
  • Los puntajes de confianza y las visualizaciones interactivas se integran en el flujo de trabajo de FoldMason.

Principales resultados:

  • FoldMason logra una calidad de alineación comparable o superior a los métodos MSTA actuales de última generación.
  • El método demuestra una mejora significativa de la velocidad, siendo dos órdenes de magnitud más rápido que las herramientas existentes.
  • Las múltiples alineaciones estructurales de FoldMason facilitan un análisis filogenético robusto, que se extiende más allá de la "zona crepuscular" de la similitud de secuencia.

Conclusiones:

  • FoldMason proporciona velocidad y precisión esenciales para el análisis de la estructura de proteínas a gran escala, crucial en la era de la predicción precisa de la estructura.
  • La herramienta apoya el análisis filogenético de proteínas distantes relacionadas, mejorando los estudios evolutivos.
  • FoldMason es un software libre, de código abierto, que promueve la accesibilidad para la comunidad científica.