Evaluación del efecto de variantes bovinas de MSTN en el pre-ARNm de empalme

Área de la Ciencia:

• Genética y Genómica
• Biología Molecular
• Ciencia Animal

Sus antecedentes:

• La miostatina (MSTN) regula negativamente el crecimiento del músculo esquelético en el ganado.
• Las variantes de pérdida de función de MSTN causan el fenotipo de 'doble musculado', pero las variantes causales a menudo carecen de validación experimental.
• El empalme de ARN es crucial para la expresión génica, y su alteración por variantes puede afectar la función de las proteínas.

Objetivo del estudio:

• Validar experimentalmente el impacto funcional de cinco variantes missense de MSTN en el empalme de ARN.
• Establecer y validar un ensayo de gen completo (FLGA) para evaluar el empalme de MSTN.
• Evaluar el rendimiento de las herramientas de predicción de empalme basadas en aprendizaje profundo (SpliceAI, Pangolin) para variantes de MSTN.

Principales métodos:

• Desarrollo de un ensayo de gen completo (FLGA) para evaluar el empalme de MSTN.
• Prueba funcional de cinco variantes missense de MSTN y una variante intrónica profunda utilizando el FLGA.
• Análisis in silico de los efectos del empalme de variantes utilizando SpliceAI y Pangolin.

Principales resultados:

• El sistema FLGA identificó con éxito los efectos del empalme, confirmando el impacto de la variante de control positivo.
• Ninguna de las cinco variantes missense de MSTN probadas demostró un efecto en el empalme de ARN.
• Las predicciones de SpliceAI y Pangolin coincidieron con precisión con los resultados experimentales del FLGA.

Conclusiones:

• El FLGA desarrollado es una herramienta robusta para analizar variantes de empalme de MSTN en el ganado.
• Las variantes missense de MSTN que se sospechaba previamente que causaban 'doble musculado' no parecen funcionar a través de un empalme de ARN alterado.
• SpliceAI y Pangolin son herramientas efectivas para priorizar variantes de MSTN para la validación experimental, mejorando la eficiencia en estudios genéticos.