Shiny-Calorie: una aplicación consciente del contexto para el análisis y la visualización de datos de calorimetría...

Área de la Ciencia:

• Fenotipado metabólico
• Bioinformática
• Investigación animal.

Sus antecedentes:

• La calorimetría indirecta es crucial para el fenotipado metabólico en la investigación preclínica.
• Las plataformas existentes carecen de software flexible y fácil de usar para la integración y el análisis de datos.
• Se necesita un enfoque unificado para diversos datos de fenotipado metabólico.

Objetivo del estudio:

• Presentar Shiny-Calorie, una aplicación de código abierto para datos de calorimetría indirecta.
• Permitir la integración transparente de datos/metadatos, análisis estadístico y visualización.
• Optimizar los flujos de trabajo de análisis y mejorar la reproducibilidad en estudios metabólicos.

Principales métodos:

• Desarrollada Shiny-Calorie, una aplicación interactiva utilizando GNU R.
• Implementado soporte para formatos de datos estándar de las principales plataformas comerciales (TSE, Sable Systems, COSMED, CLAMS/Columbus).
• Integrados métodos estadísticos avanzados para pruebas de hipótesis e interpretación de fenotipos.

Principales resultados:

• Shiny-Calorie admite diversos formatos de datos y permite la exportación de datos estandarizada.
• La aplicación facilita la exploración intuitiva de conjuntos de datos longitudinales complejos y multimodales.
• Incorpora métodos estadísticos robustos para analizar fenotipos del metabolismo energético.

Conclusiones:

• Shiny-Calorie proporciona una solución flexible, extensible y fácil de usar para el análisis de datos de calorimetría indirecta.
• La aplicación mejora la transparencia y la reproducibilidad en el fenotipado metabólico.
• Facilita la interpretación biológicamente significativa del metabolismo y el gasto energético.