Flujo de trabajo de proteómica multiorgánica de alto rendimiento para el análisis de la eficacia y toxicidad de...

Área de la Ciencia:

• Proteómica; Biología de sistemas; Espectrometría de masas

Sus antecedentes:

• El análisis de alto rendimiento de proteomas complejos es crucial para la biología de sistemas.; Los métodos existentes pueden consumir mucho tiempo para grandes conjuntos de muestras.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y validar un método de proteómica de espectrometría de masas (MS) de alto rendimiento.; Aplicar este método para analizar los efectos de los fármacos en un modelo preclínico.

Principales métodos:

• Integración de la adquisición de datos independiente de ventana estrecha (nDIA) con cromatografía de microflujo de gradiente corto.; Se logró perfilar >240 muestras por día.; Análisis de 507 muestras de tejido de ratón tratadas con L-asparaginasa (ASNasa) o su mutante.

Principales resultados:

• Se identificaron 6201 y 7466 proteínas humanas con gradientes de 1 y 2 minutos, respectivamente.; Se generó un perfil cuantitativo de 11472 proteínas después del tratamiento con fármacos.; Se confirmó el impacto de ASNasa en el metabolismo de los aminoácidos, se suprimieron los anticoagulantes y el metabolismo del colesterol, y se revelaron vías desreguladas específicas del tejido.

Conclusiones:

• El método optimizado de proteómica de alto rendimiento acelera significativamente el análisis a nivel de sistemas.; Permite la generación de información biológica e hipótesis clínicamente accionables a partir de modelos preclínicos.