Diferentes roles para SETα y SETβ en las decisiones tempranas del destino celular

Área de la Ciencia:

• Biología del desarrollo Biología del desarrollo.
• Biología celular y molecular Biología celular y molecular
• La epigenética es la epigenética.

Sus antecedentes:

• SET es un proto-oncogén nuclear con dos isoformas principales, SETα y SETβ.
• SETα es dominante en las células madre embrionarias (CEM), mientras que SETβ lo reemplaza al salir de la pluripotencia.
• Las diferencias funcionales entre SETα y SETβ no están claras debido a la redundancia estructural y de actividad.

Objetivo del estudio:

• Investigar las distintas funciones reguladoras de las isoformas SETα y SETβ.
• Para dilucidar los roles de las isoformas SET en las decisiones tempranas del destino celular.
• Para entender el mecanismo del interruptor de isoforma SET durante la salida de pluripotencia.

Principales métodos:

• Se utilizaron ESC con expresión inducible específica de la isoforma SET.
• Se realizó secuenciación de ARN en el transcurso del tiempo en fondos SET-knockout.
• Se realizó una inmunoprecipitación de cromatina específica de la isoforma seguida de una secuenciación (ChIP-seq).

Principales resultados:

• Identificó funciones regulatorias únicas para SETα y SETβ a pesar de los sitios y socios de enlace compartidos.
• Se demostró que SETα tiene funciones reguladoras distintas en sus genes diana.
• Se ha demostrado que SETβ desregula específicamente el FGF4.
• Se encontró que KLF5 regula específicamente SETα, vinculando la conmutación de la isoforma SET con el eje de señalización KLF5/FGF.

Conclusiones:

• SETα y SETβ poseen funciones reguladoras distintas que afectan la identidad celular.
• La conmutación de la isoforma SET, en particular la regulación de SETα y FGF4 por SETβ, es crucial para la especificación primitiva del endodermo.
• Se propone un modelo en el que distintas funciones de isoforma SET regulan la identidad celular temprana del blastocisto.