Un esquema estandarizado, guiado por genoma MLST para Avibacterium paragallinarum: mejora la tipificación...

Área de la Ciencia:

• Microbiología veterinaria y microbiología veterinaria.
• La patogénesis bacteriana es la patogénesis bacteriana.
• Epidemiología molecular y epidemiología molecular.

Sus antecedentes:

• Avibacterium paragallinarum causa coryza infecciosa (IC), una importante enfermedad respiratoria de las aves de corral con impacto económico.
• Los métodos de tipificación de cepas existentes (serotipo, ERIC-PCR, HPG2) carecen del poder discriminatorio necesario para estudios epidemiológicos precisos.
• La creciente prevalencia de IC requiere herramientas mejoradas para rastrear la propagación de patógenos y la dinámica de la población.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y validar un esquema de tipificación de secuencias multilocus guiado por genoma (MLST) para la diferenciación robusta de cepas de Avibacterium paragallinarum.
• Comparar el rendimiento del nuevo esquema MLST con los métodos de tipificación existentes, incluidos HPG2 y core genome MLST (cgMLST).
• Establecer una herramienta estandarizada y accesible para la vigilancia mundial y la investigación de brotes de A. paragallinarum.

Principales métodos:

• Identificación y selección de seis genes de limpieza de 42 secuencias de genoma completo (WGS) para el esquema MLST.
• Aplicación del esquema MLST desarrollado para diferenciar muestras de 75 A. paragallinarum.
• Análisis comparativo del poder discriminatorio del nuevo esquema MLST contra la tipificación HPG2, un esquema MLST publicado y cgMLST.

Principales resultados:

• El nuevo esquema MLST de seis locus demostró un poder discriminatorio superior en comparación con HPG2 y superó a un esquema MLST publicado anteriormente.
• El esquema exhibió una alta concordancia con el agrupamiento de cgMLST al tiempo que era más práctico para el uso rutinario de laboratorio.
• El análisis de 75 muestras reveló 31 tipos de secuencias distintas, lo que permitió un agrupamiento epidemiológicamente relevante a escala regional y nacional e identificar linajes persistentes.

Conclusiones:

• El esquema MLST guiado por genoma desarrollado es una herramienta reproducible, rentable y de aplicación global para la diferenciación de cepas de A. paragallinarum.
• Este sistema de tipificación estandarizado mejora la investigación de brotes, la vigilancia y los estudios de la estructura de la población de este importante patógeno avícola.
• El depósito del esquema en PubMLST asegura una nomenclatura estandarizada y una accesibilidad global, facilitando un mejor control de la coryza infecciosa.