Las limitaciones de la datación molecular utilizando una tasa de natalidad-mortalidad constante priores en el tiempo...

Área de la Ciencia:

• Biología evolutiva Biología evolutiva.
• Paleontología Paleontología.
• La filogenética es la filogenética.
• La datación molecular hace referencia a la datación molecular.

Sus antecedentes:

• La datación molecular con frecuencia entra en conflicto con los registros fósiles, particularmente para escalas de tiempo evolutivas profundas en la era paleozoica.
• Esta discrepancia a menudo se atribuye a las suposiciones simplificadas de la tasa de natalidad constante en los análisis filogenéticos.

Objetivo del estudio:

• Investigar el impacto de diferentes modelos y priores filogenéticos en la estimación del tiempo de divergencia.
• Para conciliar las estimaciones del reloj molecular con los registros fósiles al abordar la heterogeneidad de la tasa utilizando modelos de horizonte de nacimiento-muerte y datos de ocurrencia fósil.

Principales métodos:

• La inferencia filogenética se realizó en conjuntos de datos de Rhynchonellata (Brachiopoda) y Lingulidae.
• Las tasas de natalidad y mortalidad inferidas de los datos de ocurrencia fósil se incorporaron como puntos priores y de calibración.
• Se utilizó el método de calibración temporal de Marshall y la reconstrucción del estado ancestral.

Principales resultados:

• El modelo de horizonte de nacimiento-muerte redujo significativamente la discrepancia entre el reloj molecular y las estimaciones de tiempo de divergencia basadas en fósiles.
• Esta mejora se observó tanto en un clado profundamente divergente (Rhynchonellata) como en un linaje más joven (Lingulidae).
• Se demostró que los priores constantes de la tasa de natalidad-mortalidad tienen un impacto negativo en la precisión del árbol filogenético cuando está presente la heterogeneidad de la tasa.

Conclusiones:

• Los priores de tasa de natalidad-mortalidad constante son inadecuados para estudiar linajes con historias evolutivas complejas a través del tiempo profundo.
• Los priores informativos derivados de los datos de ocurrencia de fósiles pueden mejorar la calidad de los análisis de reloj molecular.
• Se necesitan modelos más flexibles para mejorar la precisión de la datación molecular en la investigación evolutiva en tiempo profundo.