Video Experimental Relacionado
Updated: Feb 12, 2026
07:21
Tick Microbiome Characterization by Next-Generation 16S rRNA Amplicon Sequencing
Published on: August 25, 2018
13.5K
Perfilamiento a nivel de especie del microbioma de Landoltia punctata bajo estrés nutricional utilizando
Chakrit Bunyoo1,2,3, Juthaporn Phonmakham2,4, Masaaki Morikawa5
1Department of Genetics, Faculty of Science, Kasetsart University, Bangkok, Thailand.
PeerJ
|February 11, 2026
Resumen
La secuenciación de ARNr 16S de longitud completa identificó 31 especies microbianas asociadas con el ganso de pato (Landoltia punctata). Las bacterias beneficiosas aumentaron bajo estrés, lo que sugiere que los microbios mejoran el crecimiento de la alga y las capacidades de fitorremediación.
Área de la Ciencia:
- Microbiología Microbiología.
- Ciencias ambientales Ciencias ambientales.
- Ciencias de las plantas Ciencias de las plantas.
Sus antecedentes:
- Duckweed es una planta acuática de rápido crecimiento que se utiliza para alimentos, piensos y tratamiento de aguas residuales.
- Las comunidades microbianas son esenciales para el crecimiento de las algas y la fitorremediación.
- En estudios anteriores se utilizó la secuenciación parcial del ARNr 16S, lo que limita la identificación a nivel de especie de los microbios asociados con la alga.
Objetivo del estudio:
- Para lograr la identificación a nivel de especie de los microbios asociados con Landoltia punctata utilizando secuenciación de ARNr 16S de longitud completa.
- Comprender cómo las comunidades microbianas responden a las condiciones de estrés.
- Identificar microbios beneficiosos potenciales para mejorar las aplicaciones de la alga patera.
Principales métodos:
- Se utilizó la secuenciación de ARNr 16S de longitud completa en muestras de Landoltia punctata de un estudio anterior.
- Se identificaron las especies microbianas predominantes y se analizaron los cambios en la comunidad bajo estrés.
- Realizó predicciones funcionales metagenómicas para inferir funciones microbianas.
Principales resultados:
- Se identificaron 31 especies microbianas predominantes asociadas con L. punctata.
- Se observó un aumento significativo en Proteobacteria y bacterias beneficiosas (por ejemplo, Roseateles depolymerans, Pelomonas saccharophila) bajo estrés.
- Las predicciones funcionales indicaron la adaptación microbiana al estrés y los beneficios potenciales para la alga patera a través de la adhesión del huésped, la formación de biopelículas y la biosíntesis de nutrientes.
Conclusiones:
- La secuenciación completa del ARNr 16S proporciona información crucial a nivel de especie sobre los microbiomas de L. punctata.
- Es probable que los microbios asociados contribuyan a la resiliencia y la eficiencia de fitorremediación de la alga.
- Los hallazgos apoyan el desarrollo de comunidades microbianas estables y beneficiosas para optimizar las aplicaciones de alga patera.
Videos de Conceptos Relacionados
02:51Multi-species Conserved Sequences
4.9K
Next-generation sequencing technologies have created large genomic databases of a variety of animals and plants. Ever since the human genome project was completed, scientists studied the genome of primates, mammals, and other phylogenetically distant living beings. Such large-scale studies have provided new insights into the evolutionary relationship between organisms.
Although the genome of each species varies greatly from each other, a few sequences are highly conserved. Such conserved...
Although the genome of each species varies greatly from each other, a few sequences are highly conserved. Such conserved...
4.9K
01:26Profile Leveling and Cross Sections
1.7K
Profile leveling and cross-sections are surveying methods used to determine and document terrain elevations for infrastructure projects such as highways, railroads, canals, and pipelines. These methods provide data for earthwork planning and alignment of proposed routes. Profile leveling involves measuring elevations along a fixed line to create a vertical terrain profile. A surveyor sets up a leveling instrument at the benchmark (BM) and records a backsight (BS) to determine the...
1.7K
01:17What is a Species?
50.6K
Overview
50.6K
02:02Responses to Salt Stress
14.7K
Salt stress—which can be triggered by high salt concentrations in a plant’s environment—can significantly affect plant growth and crop production by influencing photosynthesis and the absorption of water and nutrients.
14.7K
01:19Absorption of Nutrients
5.5K
Absorption refers to taking dietary nutrients from the intestinal lumen for transportation throughout the body. After digestion in the small intestine, carbohydrates, proteins, and fats are broken down into simpler forms. These essential macronutrients and other vital substances, such as vitamins, minerals, and water, are then prepared for absorption into the bloodstream.
Enterocytes, which are specialized polar epithelial cells, line the mucosa of the small intestinal walls. These cells...
Enterocytes, which are specialized polar epithelial cells, line the mucosa of the small intestinal walls. These cells...
5.5K
01:39Keystone Species
25.0K
Measures of species biodiversity, such as richness (i.e., the number of species present) and evenness (i.e., their relative abundance), describe an ecological community’s structure. Many factors affect community structure, including abiotic factors (e.g., sunlight and nutrients), disturbances (e.g., fire or flood), species interactions (e.g., predation or competition), and chance events (e.g., foreign species invasion). Certain species—such as keystone species—also play a...
25.0K