Descifrando los perfiles de los microbiomas de la vid desde los compartimentos de la rizosfera hasta las hojas...

Área de la Ciencia:

• Microbiología Microbiología.
• Ciencias de las plantas Ciencias de las plantas.
• La genómica es la genómica.

Sus antecedentes:

• Las comunidades microbianas asociadas a las plantas son vitales para la salud y la productividad de las plantas.
• Comprender los factores que influyen en estos microbiomas es esencial para optimizar el rendimiento y la calidad de los cultivos.

Objetivo del estudio:

• Para investigar las comunidades bacterianas y fúngicas en diferentes compartimentos de la vid (raíz, rizoplano, rizosfera, endosfera de la hoja).
• Para comparar las estructuras microbianas en dos variedades de vid ("Alachua" y "Noble").
• Explorar las correlaciones entre las comunidades microbianas, los metabolitos de la vid y los genes del huésped.

Principales métodos:

• Secuenciación de ARNr 16S e ITS para el análisis de la comunidad bacteriana y fúngica.
• Análisis de la diversidad alfa microbiana en diferentes compartimentos vegetales.
• Análisis estocástico normalizado de la relación para determinar los procesos de ensamblaje microbiano.
• Análisis de correlación y análisis ponderado de la red de coexpresión génica (WGCNA) para las interacciones microbio-metabolito y microbio-gen.

Principales resultados:

• La variedad de vid y el compartimento de plantas fueron los principales impulsores de la estructura de la comunidad microbiana.
• La diversidad bacteriana disminuyó de la rizosfera a la endosfera de las hojas; la diversidad fúngica no mostró una tendencia lineal.
• El ensamblaje microbiano estaba dominado por procesos deterministas en la endosfera de las hojas y procesos estocásticos en la rizosfera/rizoplano.
• Los procesos de ensamblaje diferían entre las comunidades bacterianas (estocásticas) y fúngicas (deterministas) en las raíces.
• Se identificaron veinte unidades taxonómicas operativas básicas compartidas (OTU) en todos los compartimentos.
• Los microbios del núcleo se correlacionaron significativamente con los compuestos stilbenos de las hojas y los genes de los núcleos.

Conclusiones:

• La composición de la microbiota de la vid está influenciada por la variedad y el compartimento de la planta, con distintos procesos de ensamblaje.
• Los microbios del núcleo compartido en las vides están asociados con los metabolitos y genes de las plantas.
• Estos hallazgos ofrecen información sobre las funciones reguladoras de los microbios asociados a la vid y su potencial para la mejora de los cultivos.