La resolución unicelular de la regulación de empalme en las células mononucleares de la sangre periférica descubre...

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Inmunología Inmunología.
• Biología Molecular Biología Molecular

Sus antecedentes:

• No se comprende bien el impacto de la variación genética en el empalme alternativo (EA) en diversas células y poblaciones inmunes.
• Investigar AS en diferentes tipos de células inmunes y grupos demográficos es crucial para comprender los rasgos complejos.

Objetivo del estudio:

• Investigar sistemáticamente la variación de empalme en la resolución de una sola célula en poblaciones europeas.
• Para identificar eventos AS específicos de tipo celular y su regulación genética (cis-sQTLs).
• Explorar la relación entre la regulación del empalme y los loci de susceptibilidad genética para rasgos complejos.

Principales métodos:

• Utilizó la cohorte OneK1K con genotipos coincidentes y datos de secuenciación de ARN de una sola célula (scRNA-seq) de 980 individuos europeos.
• Realizó un análisis de empalme alternativo específico para cada tipo de célula en 13 tipos de células inmunes.
• Se realizaron análisis de loci de rasgos cuantitativos cis-splicing (cis-sQTL) y trans-sQTL, junto con la colocalización con loci GWAS.

Principales resultados:

• Se identificaron extensos eventos AS específicos del tipo de célula y cis-sQTLs independientes, con algunos que muestran patrones sesgados por sexo y edad.
• Demostró que los cis-sQTL específicos de tipo celular comparten señales con los loci GWAS para 30 rasgos poligénicos, destacando el papel del empalme en la heredabilidad de rasgos complejos.
• Descubrieron efectos distales de variantes genéticas en el empalme RPS24 a través de la regulación del regulador de empalme IVNS1ABP.

Conclusiones:

• La variación genética moldea significativamente los programas de empalme entre los tipos de células inmunes y los contextos demográficos en las poblaciones europeas.
• La regulación del empalme es un mecanismo clave a través del cual las variantes genéticas influyen en rasgos complejos.
• Estableció un marco mecanicista para comprender la regulación mediada por empalme de rasgos complejos.