Ensamblaje del genoma a nivel de cromosomas de la almeja de Venus rayada Chamelea gallina

Área de la Ciencia:

• Biología Marina Biología Marina.
• La genómica es la genómica.
• La acuicultura es la acuicultura.

Sus antecedentes:

• La almeja de Venus rayada (Chamelea gallina) es económicamente importante para el mar Adriático y la pesca europea.
• Los datos genómicos limitados para C. gallina impiden la investigación sobre su biología, adaptación al cambio climático y respuestas al estrés.

Objetivo del estudio:

• Para generar el primer ensamblaje del genoma a nivel cromosómico para Chamelea gallina.
• Proporcionar un recurso genómico fundamental para la investigación futura y el manejo sostenible de este bivalvo.

Principales métodos:

• Utilizó la secuenciación PacBio HiFi e Illumina para el ensamblaje del genoma.
• Empleó andamios Hi-C para mejorar la contiguidad y la precisión estructural.
• Realizó la anotación del genoma y ensambló el genoma mitocondrial completo.

Principales resultados:

• Generó un ensamblaje de genoma a nivel cromosómico de 1,81 Gb con alta contiguidad (armazón N50 de 100,3 Mb) y integridad (95,6% BUSCO).
• El conjunto consta de 19 andamios, que reflejan con precisión el cariotipo de la especie.
• Anotó 58.203 genes codificadores de proteínas y identificó elementos repetitivos que cubren el 54,40% del genoma.

Conclusiones:

• El ensamblaje del genoma a nivel cromosómico de C. gallina es un avance significativo para la genómica bivalva.
• Este recurso facilitará la genómica comparativa, el desarrollo de marcadores moleculares para la trazabilidad y estrategias de gestión informadas para C. gallina.
• Permite una comprensión más profunda de la resiliencia y la adaptación de C. gallina a los cambios ambientales.