Registro genómico multicanal de información biológica con Engram

Área de la Ciencia:

• Biología sintética Biología sintética.
• La genómica es la genómica.
• Biología molecular La biología molecular.

Sus antecedentes:

• El registro molecular permite la medición temporal de los procesos biológicos.
• Los métodos existentes tienen limitaciones en escalabilidad y multiplexación.
• Los elementos cis-reguladores (CREs) controlan la expresión génica y son objetivos clave para el estudio.

Objetivo del estudio:

• Proporcionar un protocolo detallado para el sistema Enhancer-mediated Genomic Recording of Activity in Multiplex (ENGRAM) para el registro genómico de la actividad en el multiplex.
• Para esbozar las consideraciones de diseño, fortalezas, limitaciones y aplicaciones de Engram.
• Para permitir la detección de alto rendimiento de CREs y la grabación de señales multiplexadas.

Principales métodos:

• ENGRAM utiliza inserciones mediadas por edición primaria para crear registros genómicos estables de la actividad de CRE.
• El sistema está diseñado para la multiplexación inherente, registrando hasta 256 actividades distintas de CRE con inserciones de cuatro pares de bases.
• La compatibilidad con la máquina de escribir ADN facilita la captura del orden de la señal.

Principales resultados:

• El protocolo detalla los procedimientos experimentales y el análisis de datos para ENGRAM.
• ENGRAM demuestra capacidades de multiplexación para el registro de actividad de CRE.
• El sistema es compatible con la máquina de escribir ADN para la captura de señales temporales.

Conclusiones:

• ENGRAM proporciona una plataforma robusta y escalable para el registro molecular de la actividad CRE.
• La tecnología facilita el cribado de alto rendimiento y el análisis de señales biológicas multiplexadas.
• Los experimentos de Engram son factibles en 5-6 semanas para investigadores con conocimientos básicos de biología molecular.