Jove
Visualize
Contáctanos
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
ACERCA DE JoVE
Visión GeneralLiderazgoBlogCentro de Ayuda JoVE
AUTORES
Proceso de PublicaciónConsejo EditorialAlcance y PolíticasRevisión por ParesPreguntas FrecuentesEnviar
BIBLIOTECARIOS
TestimoniosSuscripcionesAccesoRecursosConsejo Asesor de BibliotecasPreguntas Frecuentes
INVESTIGACIÓN
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of ExperimentsArchivo
EDUCACIÓN
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab ManualCentro de Recursos para ProfesoresSitio de Profesores
Términos y Condiciones de Uso
Política de Privacidad
Políticas

Videos de Conceptos Relacionados

The Eukaryotic Promoter Region02:40

The Eukaryotic Promoter Region

19.1K
The eukaryotic promoter region is a segment of DNA located upstream of a gene. It contains an RNA polymerase binding site, a transcription start site, and several cis-regulatory sequences.  The proximal promoter region is located in the vicinity of the gene and has cis-regulatory sequences and the core promoter. The core promoter is the binding site for RNA polymerase and is usually located between -35 and +35 nucleotides from the transcription start site. The distal promoter regions are...
19.1K
The Eukaryotic Promoter Region02:40

The Eukaryotic Promoter Region

4.0K
4.0K
DNA Microarrays02:34

DNA Microarrays

21.4K
Microarrays are high-throughput and relatively inexpensive assays that can be automated to analyze large quantities of data at a time. They are used in genome-wide studies to compare gene or protein expression under two varied conditions, such as healthy and diseased states. Microarrays consist of glass or silica slides on which probe molecules are covalently attached through surface functionalization. Most commonly, the slides are prepared through the chemisorption of silanes to silica...
21.4K

También podría leer

Artículos Relacionados

Artículos vinculados a este trabajo por autores compartidos, revista y gráfico de citas.

Ordenar por
Same author

Invasive Pulmonary Mucormycosis Due to Rhizopus oryzae in a Patient With Uncontrolled Diabetes.

Cureus·2026
Same author

Soil to host environmental determinants fueling horizontal gene transfer and global AMR dissemination.

Folia microbiologica·2026
Same author

Retraction Note: COVID-19 Detection using adopted convolutional neural networks and high-performance computing.

Multimedia tools and applications·2026
Same author

Correction: Mohite et al. Bioactive Compound-Fortified Nanomedicine in the Modulation of Reactive Oxygen Species and Enhancement of the Wound Healing Process: A Review. <i>Pharmaceutics</i> 2025, <i>17</i>, 855.

Pharmaceutics·2026
Same author

AgriTrack framework for AI-based tracking of pest migration through farmers' helpline data.

Scientific reports·2026
Same author

Fabrication of vesicle-incorporated etoposide-loaded nanocochleates for improved anticancer efficacy.

Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology·2026

Video Experimental Relacionado

Updated: Feb 20, 2026

A Computational Pipeline for Intergenic/Intragenic Enhancer RNA Quantification in Mouse Embryonic Stem Cells
06:02

A Computational Pipeline for Intergenic/Intragenic Enhancer RNA Quantification in Mouse Embryonic Stem Cells

Published on: October 28, 2025

577

GPXplore: un marco computacional inteligente para la extracción precisa de promotores de genes

Shruti Godara1, Samarth Godara2, Shbana Begam3

  • 1ICFRE-Forest Research Institute, Dehradun, Uttarakhand, India.

Frontiers in bioinformatics
|February 19, 2026
PubMed
Resumen

GPXplore es una nueva herramienta computacional para la extracción precisa de promotores de genes. Ofrece mayor velocidad y facilidad de uso para el análisis de datos genómicos en estudios de regulación génica.

Palabras clave:
aguas abajoregulador génicogenómicapromotoresaguas arriba

Más Videos Relacionados

Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations
11:36

Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations

Published on: April 21, 2023

3.1K
In vivo Application of the REMOTE-control System for the Manipulation of Endogenous Gene Expression
08:54

In vivo Application of the REMOTE-control System for the Manipulation of Endogenous Gene Expression

Published on: March 29, 2019

7.6K

Videos de Experimentos Relacionados

Last Updated: Feb 20, 2026

A Computational Pipeline for Intergenic/Intragenic Enhancer RNA Quantification in Mouse Embryonic Stem Cells
06:02

A Computational Pipeline for Intergenic/Intragenic Enhancer RNA Quantification in Mouse Embryonic Stem Cells

Published on: October 28, 2025

577
Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations
11:36

Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations

Published on: April 21, 2023

3.1K
In vivo Application of the REMOTE-control System for the Manipulation of Endogenous Gene Expression
08:54

In vivo Application of the REMOTE-control System for the Manipulation of Endogenous Gene Expression

Published on: March 29, 2019

7.6K

Área de la Ciencia:

  • Genómica
  • Biología Computacional

Sus antecedentes:

  • La extracción precisa de la región promotora de genes es crucial para los estudios de regulación génica.
  • Las herramientas actuales carecen de escalabilidad, usabilidad y rendimiento óptimo.

Objetivo del estudio:

  • Introducir GPXplore, una herramienta computacional fácil de usar para la extracción precisa de promotores de genes.
  • Abordar las limitaciones de las herramientas existentes en cuanto a velocidad, escalabilidad y facilidad de uso.

Principales métodos:

  • Utiliza el procesamiento de datos vectorizados para una extracción eficiente de secuencias.
  • Admite parámetros personalizables para definir las longitudes de la región promotora.
  • Ofrece interfaces de línea de comandos y de usuario gráfico (GUI) para la accesibilidad.

Principales resultados:

  • Demuestra una reducción significativa en el tiempo de procesamiento de datos.
  • Logró alta precisión y confiabilidad en ocho conjuntos de datos genómicos diversos.
  • Validó la compatibilidad con los sistemas operativos Windows y Ubuntu.

Conclusiones:

  • GPXplore proporciona una solución robusta, automatizada y flexible para el análisis de promotores de alto rendimiento.
  • Facilita la investigación de la regulación génica para científicos con diversos niveles de experiencia computacional.
  • Mejora la edición génica, la genómica funcional y la investigación de enfermedades mediante la extracción eficiente de promotores.