El análisis transcriptómico de una sola célula y el aprendizaje automático identifican a ATAD3A como un gen clave que...

Área de la Ciencia:

• Oncología Oncología.
• Biología Molecular Biología Molecular
• La genómica es la genómica.

Sus antecedentes:

• Las membranas del retículo endoplasmático asociadas a las mitocondrias (MAM) son cruciales en el cáncer, pero su papel en el cáncer de vejiga (BCa) no se comprende bien.
• Investigar la función de la MAM es vital para comprender la progresión de la BCa y la resistencia al tratamiento.

Objetivo del estudio:

• Para explorar el papel de MAM en el cáncer de vejiga.
• Para identificar biomarcadores pronósticos para BCa e investigar su relación con la resistencia a la quimioterapia.
• Para dilucidar los mecanismos moleculares que subyacen a la función de MAM en BCa.

Principales métodos:

• Análisis exhaustivo de la secuenciación del ARN y los datos transcriptómicos de células únicas.
• Construcción y validación de un modelo de características de riesgo MAM utilizando regresión LASSO-Cox, análisis Kaplan-Meier y ROC.
• Se emplearon análisis de comunicación celular (CellChat), cuantificación de células inmunes (CIBERSORT), aprendizaje automático y transcriptómica espacial. La función de ATAD3A fue validada in vitro e in vivo.

Principales resultados:

• Se desarrolló una firma de pronóstico MAM robusta, que predice resultados pobres para los pacientes con BCa.
• Las puntuaciones altas de MAM se correlacionan con un microambiente tumoral inmunosupresor y la resistencia a la quimioterapia.
• ATAD3A fue identificado como un gen clave que predice la resistencia al cisplatino y al platino, crucial para el tratamiento de la BCa. ATAD3A knockdown suprimió el crecimiento tumoral.

Conclusiones:

• La MAM está significativamente asociada con la resistencia a la quimioterapia BCa.
• ATAD3A es un biomarcador pronóstico y objetivo terapéutico potencial para el cáncer de vejiga.
• El aprendizaje automático y el análisis multi-omics revelaron el papel de ATAD3A en el mantenimiento de la integridad del MAM y la promoción de la quimiorresistencia.