Perfilado molecular y estructural integrador de los genes de virulencia de Escherichia coli en las infecciones...

Área de la Ciencia:

• Microbiología Microbiología.
• Genética La genética.
• La bioinformática es la bioinformática.

Sus antecedentes:

• Escherichia coli (E. coli) es una de las principales causas de infecciones del tracto urinario (ITU) y úlceras del pie diabético, particularmente en individuos inmunocomprometidos.
• La E. coli patógena (PEC) utiliza genes de virulencia (fimH, hlyA, usp, traT, papC) para causar infecciones, evadir la inmunidad y dañar el tejido.
• Existe una brecha en los estudios integradores que perfilan los genes y mutaciones de virulencia PEC, lo que dificulta la comprensión de la patogenicidad, la resistencia a los antimicrobianos y el desarrollo de terapias dirigidas.

Objetivo del estudio:

• Para investigar la prevalencia de genes de virulencia clave en E. coli aislados de pacientes diabéticos con infecciones urinarias o úlceras en el pie.
• Para identificar y caracterizar mutaciones dentro de estos genes de virulencia utilizando herramientas de bioinformática.
• Explorar las implicaciones de estos hallazgos para la patogenicidad, la resistencia a los antimicrobianos y las estrategias terapéuticas.

Principales métodos:

• Se recogieron 210 aislamientos de E. coli de pacientes diabéticos en el Complejo Médico Hayatabad (HMC), Peshawar.
• Se confirmó la identificación de E. coli mediante pruebas bioquímicas y PCR dirigidas al ARNr 16S.
• Se evaluó la resistencia a los antibióticos a través de la difusión de disco de Kirby-Bauer; se detectaron genes de virulencia utilizando PCR; se analizaron los datos de secuenciación con herramientas de bioinformática (MSA, PROVEAN, InterProScan, SWISS-MODEL).

Principales resultados:

• Los aislados diabéticos mostraron una prevalencia significativamente mayor de los cinco genes de virulencia estudiados (fimH, hlyA, usp, traT, papC) (p < 0,001).
• Las mutaciones dañinas fueron predichas por PROVEAN, incluyendo V20G (FimH), S130L (HlyA), G3R (USP), G1V/Q104L (PapC), y E27K (TraT).
• El modelado estructural mostró cambios conformacionales localizados, los dominios funcionales conservados fueron identificados por InterProScan, y el análisis filogenético reveló divergencia evolutiva en genes mutados.

Conclusiones:

• Este estudio pone de relieve la presencia significativa de factores de virulencia y mutaciones en E. coli de pacientes diabéticos.
• Las mutaciones identificadas pueden contribuir a la patogenicidad y la resistencia a los antimicrobianos.
• Hace hincapié en la necesidad de vigilancia molecular y el desarrollo de terapias dirigidas para combatir las infecciones por E. coli resistentes a los antibióticos en esta población vulnerable.