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Updated: Feb 24, 2026

Identification of Rare Bacterial Pathogens by 16S rRNA Gene Sequencing and MALDI-TOF MS

Identification of Rare Bacterial Pathogens by 16S rRNA Gene Sequencing and MALDI-TOF MS

Published on: July 11, 2016

MALDI-TOF identificación errónea de Sanguibacteroides justesenii: confirmación por secuenciación del ARNr 16S

Valentin Bedfert¹, Stéphane Corvec², Marion Leterrier-Plong¹

¹Laboratoire de Biologie Médicale, GCS Biologie85, Centre Hospitalier Départemental de Vendée, 85000 La Roche sur Yon, France.

Diagnostic microbiology and infectious disease

|February 22, 2026

Resumen

Sanguibacteroides justesenii, una rara bacteria anaeróbica, fue identificada erróneamente por MALDI-TOF MS en un caso de shock séptico. La secuenciación del gen 16S rRNA confirmó S. justesenii, destacando la necesidad de métodos moleculares cuando los resultados MALDI-TOF son inciertos para especies raras.

Área de la Ciencia:

Microbiología Médica Microbiología médica.
Diagnóstico Clínico El diagnóstico clínico.
Enfermedades infecciosas Enfermedades infecciosas.

Sus antecedentes:

Sanguibacteroides justesenii es un raro bacilo anaeróbico Gram-negativo con un significado clínico poco claro.
La identificación precisa de S. justesenii es un desafío con los métodos de diagnóstico convencionales.

Objetivo del estudio:

Para reportar un caso de bacteriemia por S. justesenii en un paciente con shock séptico después de una perforación del colon.
Para resaltar las limitaciones de MALDI-TOF MS en la identificación de bacterias anaerobias raras y enfatizar la importancia de los métodos moleculares para la confirmación.

Principales métodos:

Informe de caso de una paciente de 58 años con insuficiencia cardíaca aguda y posterior shock séptico.
Análisis de cultivos de sangre utilizando MALDI-TOF MS (Bruker®) y secuenciación de genes de ARNr 16S.
Comparación de los resultados de identificación entre MALDI-TOF MS y 16S secuenciación de genes de ARNr.

Principales resultados:

MALDI-TOF MS inicialmente identificó erróneamente el aislado como Gabonibacter massiliensis (puntuación 2.19).
La secuenciación del gen del ARNr 16S confirmó que el aislado era S. justesenii.
Los análisis repetidos de MALDI-TOF MS en dos laboratorios arrojaron la misma identificación errónea, lo que indica limitaciones en la base de datos para especies raras.

Conclusiones:

Este caso subraya los desafíos en la identificación de S. justesenii y el potencial de identificación errónea por MALDI-TOF MS debido a las limitaciones de la base de datos.
Los métodos moleculares como la secuenciación de genes de ARNr 16S son cruciales para la identificación precisa de bacterias anaerobias raras cuando los resultados de MALDI-TOF MS son cuestionables.
El paciente se recuperó con éxito con tratamiento con amoxicilina y metronidazol, y este caso enfatiza la necesidad de confirmación molecular en el diagnóstico de infecciones raras del torrente sanguíneo.

Palabras clave:

Gabonibacter massiliensis es una bacteria muy común.Identificación por espectrometría de masa de desorción/ionización láser asistida por matriz, tiempo de vuelo y identificación por espectrometría de masa.Sanguibacteroides sólo se encuentra aquí.La secuenciación de secuencias.Los anaeróbicos también.

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