mViSE: Un motor de búsqueda visual para el análisis de múltiples imágenes de tejido cerebral IHC (proteómica...

Área de la Ciencia:

• La neurociencia es la neurociencia.
• Biología computacional Biología computacional.
• Biotecnología La biotecnología es la biotecnología.

Sus antecedentes:

• Las imágenes de proteómica espacial de diapositivas completas del tejido cerebral son grandes y complejas, lo que plantea desafíos analíticos.
• Los métodos actuales a menudo requieren experiencia en programación o carecen de capacidades de análisis integrales.

Objetivo del estudio:

• Introducir mVISE, un motor de búsqueda visual interactivo para el análisis libre de programación de datos proteómicos espaciales múltiples.
• Para permitir la recuperación y el perfil de comunidades celulares y nichos multicelulares dentro del tejido cerebral.

Principales métodos:

• Desarrolló codificadores múltiplex entrenados en morfología celular, quimioarquitectura, citoarquitectura y mieloarquitectura sin anotación humana.
• Se integran señales visuales a través de canales de imagen para superar las limitaciones del modelo de base.
• Combinación de múltiples codificadores para funcionalidades de búsqueda especializadas.

Principales resultados:

• mVISE validado para la recuperación de células individuales, pares de células y parches de tejido.
• Demostró una delimitación precisa de las capas corticales, las regiones cerebrales y las subregiones.
• Mostró el análisis libre de programación y basado en consultas de datos complejos de proteómica espacial.

Conclusiones:

• mVISE proporciona una alternativa efectiva y accesible para el análisis de conjuntos masivos de datos de proteómica espacial.
• La herramienta facilita el análisis exploratorio, el perfil comparativo y la delineación de las estructuras cerebrales.
• mVISE está disponible como un plug-in de código abierto de QuPath, promoviendo una adopción más amplia en la investigación en neurociencias.