Catálogo del Modelo PRECISE TBI: Aumentando la Accesibilidad y la Reproducibilidad en la Investigación de TBI

Área de la Ciencia:

• Neurociencia
• Investigación Biomédica
• Ciencia de Datos

Sus antecedentes:

• La investigación preclínica de lesión cerebral traumática (TBI) enfrenta desafíos en la traslación clínica debido a recursos fragmentados y a la presentación inconsistente de variables experimentales.
• Los modelos experimentales existentes para TBI varían significativamente en mecanismo, parámetros, especie y edad, lo que dificulta las comparaciones entre estudios y la reproducibilidad.

Objetivo del estudio:

• Presentar el catálogo de modelos PRECISE-TBI, un recurso centralizado y consultable para consolidar metadatos de estudios preclínicos publicados de TBI.
• Mejorar la transparencia, la reproducibilidad y el intercambio de datos en la investigación de TBI mediante la integración de anotaciones curadas y el enlace a protocolos y conjuntos de datos.

Principales métodos:

• Desarrolló un catálogo centralizado integrando anotaciones curadas de más de 450 estudios preclínicos publicados de TBI.
• Consolidó metadatos que incluyen edad, sexo, cepa, tipo de modelo, dispositivo y parámetros de lesión para cada estudio.
• Vinculó las entradas del catálogo con los protocolos y conjuntos de datos disponibles para promover los principios de datos FAIR.

Principales resultados:

• El análisis reveló lagunas iniciales en la presentación de variables críticas como el dispositivo, la edad y el peso.
• La presentación del sexo ha mejorado significativamente, con más del 90% de los estudios recientes que incluyen esta información.
• La presentación de la cepa es generalmente consistente, particularmente para la subcepa de ratones C57.

Conclusiones:

• El catálogo de modelos PRECISE-TBI sirve como una herramienta valiosa para mejorar el diseño del estudio y la reproducibilidad en la investigación preclínica de TBI.
• El catálogo facilita las comparaciones entre estudios, identifica las lagunas en la presentación de informes y conecta la literatura con recursos esenciales como protocolos y conjuntos de datos.
• Esta iniciativa promueve los principios de datos FAIR dentro de la comunidad de investigación de TBI.