Portal SenNet: Creación, optimización y uso

Área de la Ciencia:

• Gerontología y Biología Celular
• Bioinformática y Ciencia de Datos
• Infraestructura de Investigación Biomédica

Sus antecedentes:

• La senescencia celular es un proceso fundamental del envejecimiento, pero su complejidad dificulta su estudio integral.
• La heterogeneidad y la dependencia del contexto de las células senescentes presentan importantes desafíos de investigación.
• El Programa de la Red de Senescencia Celular (SenNet) tiene como objetivo superar estas limitaciones mediante la generación de datos a gran escala.

Objetivo del estudio:

• Presentar el Portal de Datos SenNet como un recurso público para la investigación de la senescencia celular.
• Detallar la arquitectura del portal, los tipos de datos y las capacidades analíticas.
• Mostrar la utilidad del portal para mejorar la comprensión del envejecimiento y la senescencia.

Principales métodos:

• Generación de conjuntos de datos multimodales y multitejido que perfilan células senescentes.
• Armonización de datos de una sola célula, espaciales, de imagen, transcriptómicos y proteómicos.
• Desarrollo de protocolos estandarizados y herramientas analíticas para la caracterización de la senescencia.

Principales resultados:

• El Portal de Datos SenNet proporciona acceso abierto a 1.753 conjuntos de datos humanos y de ratón en 15 órganos.
• Los datos incluyen catálogos completos de biomarcadores de senescencia y protocolos estandarizados.
• El portal admite el análisis integrado, el mapeo espacial y las comparaciones entre especies.

Conclusiones:

• El Portal de Datos SenNet es un recurso crítico para el estudio sistemático de la senescencia celular.
• Facilita el descubrimiento de biomarcadores, la generación de hipótesis y el análisis espacial en la investigación del envejecimiento.
• Las futuras extensiones mejorarán las capacidades de ómicas espaciales y caracterización de senotipos.