AntibioticDB: Una base de datos de acceso abierto actualizada y mejorada para la comunidad de investigación y...

Área de la Ciencia:

• Farmacología y Química Medicinal
• Quimioinformática y Bioinformática

Sus antecedentes:

• AntibioticDB es una base de datos de agentes antibacterianos de libre acceso, establecida en 2017 y dirigida por la Alianza Mundial para la Investigación y el Desarrollo de Antibióticos (GARDP) desde 2021.
• La base de datos tiene como objetivo apoyar y acelerar la investigación y el desarrollo de nuevas terapias antibacterianas.
• Las versiones anteriores requerían mejoras para servir mejor a la comunidad científica.

Objetivo del estudio:

• Anunciar y describir la última versión de la base de datos AntibioticDB.
• Destacar expansiones significativas, funcionalidades actualizadas e integración de datos mejorada.
• Enfatizar el papel de la base de datos como un recurso global integral para agentes antibacterianos.

Principales métodos:

• Rediseño del portal web con funcionalidad mejorada para el usuario.
• Integración recíproca con la Guía de Farmacología de la IUPHAR/BPS.
• Incorporación de identificadores químicos estándar (SMILES, InChI, InChI Key) e imágenes de estructuras 2D.
• Armonización de la terminología para optimizar la búsqueda en la base de datos.
• Minería continua de literatura y curación de datos para nuevos compuestos antibacterianos.

Principales resultados:

• AntibioticDB ahora presenta más de 3500 entradas, significativamente ampliadas con respecto a versiones anteriores.
• Se ha incorporado un aumento sustancial de antibióticos de productos naturales históricos.
• La captura de datos mejorada incluye estructuras químicas e identificadores, lo que mejora la utilidad de los datos.
• La base de datos se actualiza continuamente con compuestos antibacterianos recién reportados.

Conclusiones:

• La versión actualizada de AntibioticDB es un recurso más completo y fácil de usar para los investigadores.
• Su contenido ampliado, particularmente los antibióticos de productos naturales, y la integración de datos mejorada facilitan el descubrimiento de fármacos.
• AntibioticDB solidifica su posición como el recurso global más completo para agentes antibacterianos.