Análisis de concordancia de perfiles de ADN y ARN: El estudio IMPACT2 de MD Anderson en oncología de precisión

Área de la Ciencia:

• Oncología Oncología.
• La genómica es la genómica.
• Biología Molecular Biología Molecular

Sus antecedentes:

• El perfil de ADN es estándar para la selección del tratamiento contra el cáncer, pero el perfil de ARN aún está bajo investigación.
• El estudio IMPACT2 (NCT02152254) evaluó el perfil molecular para guiar la terapia contra el cáncer en varios tipos de tumores.

Objetivo del estudio:

• Explorar las asociaciones entre las alteraciones del ADN y el ARN en pacientes con cáncer.
• Investigar el vínculo entre el número de genes con expresión alterada y la supervivencia global (SG).
• Para evaluar la concordancia entre los resultados de perfiles de ADN y ARN.

Principales métodos:

• El perfil molecular, incluida la secuenciación de ADN de próxima generación, se realizó en 829 pacientes del estudio IMPACT2.
• Se realizó un perfil de ARN para 253 pacientes.
• Se evaluó la concordancia entre los perfiles de ADN y ARN, y se analizó la OS en 217 pacientes tratados.

Principales resultados:

• Cincuenta pacientes mostraron 58 eventos concordantes de ADN y ARN, de los cuales 41 demostraron una concordancia estadísticamente significativa.
• 123 pares de genes mostraron asociaciones significativas entre las alteraciones genómicas y de expresión (p < 0,05), incluidas las alteraciones de TP53 con sobreexpresión de VEGFA.
• Los pacientes con ≥6 genes que muestran expresión alterada tuvieron una OS mediana más corta (6,7 meses) en comparación con aquellos con 0-2 (9,8 meses) o 3-5 (11,9 meses) genes alterados (p = 0,03).

Conclusiones:

• El perfil de ARN demuestra la posibilidad de acción potencial en la selección del tratamiento del cáncer.
• Un mayor número de genes con expresión alterada (≥6) se asocia con una menor supervivencia general.
• La concordancia observada entre las alteraciones de TP53 y la sobreexpresión de VEGFA puede informar la respuesta de bevacizumab en los cánceres con mutantes de TP53.