Escenario de eyección de cuentas en la ionización por electrospray de ácidos nucleicos multidominio

Área de la Ciencia:

• Bioquímica
• Química Analítica
• Biología Estructural

Sus antecedentes:

• La comprensión de la ionización de biomoléculas es clave para la espectrometría de masas nativa (MS).
• La carga por ionización por electrospray (ESI) y la retención de la conformación son críticas para interpretar los datos de MS nativa.
• Los ácidos nucleicos presentan desafíos de ionización únicos debido a sus complejas estructuras.

Objetivo del estudio:

• Investigar la carga y la conformación en fase gaseosa de constructos de ácidos nucleicos con 'cuentas' de G-cuádruplex unidas por regiones de politimidina.
• Elucidar los mecanismos de producción de iones y la preservación estructural durante la ionización por electrospray.
• Ampliar el marco conceptual para la ionización de ácidos nucleicos en MS nativa.

Principales métodos:

• Análisis de espectrometría de masas nativa (MS nativa) de constructos de ácidos nucleicos.
• Examen de las distribuciones de estado de carga y sección transversal de colisión.
• Comparación de datos experimentales con mecanismos de ionización propuestos (por ejemplo, eyección de cuentas, residuo de carga, eyección de cadena).

Principales resultados:

• Los oligonucleótidos con G-cuádruplex plegados mostraron distribuciones multimodales de estado de carga y sección transversal de colisión, lo que indica múltiples conjuntos conformacionales.
• Los mecanismos de producción de iones variaron con el estado de carga, incluyendo escenarios de eyección de cuentas, residuo de carga y eyección de cadena.
• Las estructuras locales se conservaron en iones cargados por encima del límite de Rayleigh, lo que sugiere la presencia de subunidades plegadas.

Conclusiones:

• El plegamiento de las subunidades de G-cuádruplex impacta significativamente la ionización de ácidos nucleicos y la conformación en fase gaseosa.
• La fuerza iónica y la posición del G-cuádruplex influyen en la carga y la retención estructural.
• Los hallazgos proporcionan una comprensión más amplia de los mecanismos de ionización de ácidos nucleicos en MS nativa.