Caracterización Toxicogenómica de la Carcinogénesis de la Vejiga Asociada al Ácido Perfluorooctanoico

Área de la Ciencia:

• Toxicología ambiental
• Genómica del cáncer
• Bioinformática

Sus antecedentes:

• El ácido perfluorooctanoico (PFOA) es un contaminante ambiental con posibles riesgos para la salud.
• Comprender los vínculos moleculares entre la exposición a productos químicos y el cáncer es crucial para la salud pública.
• La transcriptómica del cáncer de vejiga ofrece información sobre el desarrollo y la progresión del tumor.

Objetivo del estudio:

• Para tender un puente computacional entre la predicción de dianas toxicológicas y la transcriptómica del cáncer de vejiga.
• Identificar firmas y vías moleculares compartidas entre la exposición a PFOA y el cáncer de vejiga.
• Desarrollar un modelo predictivo para el cáncer de vejiga basado en las características moleculares identificadas.

Principales métodos:

• Se ensamblaron 9.591 supuestas dianas moleculares asociadas con PFOA de cinco bases de datos.
• Se realizaron análisis de expresión diferencial y redes de coexpresión génica en cinco cohortes de cáncer de vejiga.
• Se empleó análisis de enriquecimiento funcional, aprendizaje automático (SHAP) y acoplamiento molecular para el análisis de vías y la predicción.

Principales resultados:

• Identificó 69 genes candidatos, relacionados principalmente con el control del ciclo celular y el daño del ADN.
• Desarrolló un clasificador de nueve genes con un excelente rendimiento discriminatorio (AUC 0.986 entrenamiento, 0.944-1.000 externo).
• MCM7 identificado como predictor clave
• el PFOA mostró una fuerte interacción predicha con IGFBP2.

Conclusiones:

• Análisis integrado de predicción toxicológica y transcriptómica para vincular la exposición a PFOA con el cáncer de vejiga.
• El clasificador de nueve genes muestra un rendimiento robusto y captura vías de intersección de PFOA.
• Proporciona una perspectiva a nivel de sistemas sobre los programas transcripcionales compartidos entre la exposición química y la biología del cáncer.