Mutación o disomía uniparental? Evaluación de patrones de herencia anómalos utilizando redes bayesianas orientadas a...

Área de la Ciencia:

• Genética
• Ciencias Forenses
• Bioestadística

Sus antecedentes:

• Las pruebas de paternidad tradicionalmente asumen que las incompatibilidades son paternas o se deben a mutaciones.
• La disomía uniparental (UPD) se reconoce cada vez más como un factor en la herencia genética.
• Los modelos existentes pueden no abordar adecuadamente patrones de herencia complejos como la UPD.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un marco estadístico para las pruebas de paternidad que incorpore tanto eventos de mutación como UPD.
• Crear un modelo de Red Bayesiana Orientada a Objetos (OOBN) para evaluar los resultados de tríos de paternidad.
• Evaluar estadísticamente las razones de verosimilitud (LR) para las hipótesis de paternidad, considerando la herencia atípica.

Principales métodos:

• Diseñó un modelo OOBN utilizando el software GeNIe Academic.
• Desarrolló una herramienta computacional en Python utilizando el paquete pmgpy.
• Simuló tres millones de tríos de paternidad para probar la capacidad del modelo para identificar y distinguir mutaciones y UPD.

Principales resultados:

• El modelo OOBN calcula con éxito los valores de LR, teniendo en cuenta con precisión los eventos de mutación y UPD.
• El marco proporciona resultados estadísticos imparciales, sin asumir el origen paterno de las incompatibilidades.
• El modelo puede estimar las probabilidades de mutación y UPD basándose en datos genéticos y frecuencias poblacionales.

Conclusiones:

• El marco OOBN propuesto ofrece un método robusto para las pruebas de paternidad, especialmente cuando las discrepancias sugieren herencia atípica.
• Mejora la precisión de la estimación de la probabilidad de paternidad al incluir eventos de UPD y mutación.
• La herramienta computacional permite el procesamiento escalable de grandes conjuntos de datos para el análisis de parentesco genético.