Mimetismo molecular de conjunto correlaciona con la reactividad cruzada de anticuerpos en estudios a escala de...

Área de la Ciencia:

• Inmunología
• Biofísica
• Biología Computacional

Sus antecedentes:

• La energética de la unión proteína-proteína implica equilibrios conformacionales e interacciones interfaciales.
• La unión anticuerpo-proteína típicamente asume cambios conformacionales mínimos en la proteína, centrándose en las interacciones interfaciales.
• El mimetismo molecular, donde los anticuerpos se unen a objetivos disímiles, sugiere un papel para las contribuciones conformacionales.

Objetivo del estudio:

• Investigar el papel de las contribuciones conformacionales en la unión anticuerpo-proteína y el mimetismo molecular.
• Introducir y evaluar el concepto de "mimetismo molecular de conjunto" (EMM).
• Evaluar la prevalencia de EMM en la reactividad cruzada entre antígenos virales y el proteoma humano.

Principales métodos:

• Se utilizó un método novedoso para evaluar la compatibilidad termodinámica entre conjuntos conformacionales de proteínas.
• Se evaluaron las contribuciones de afinidad de unión de los conjuntos conformacionales a escala de proteoma.
• Se desarrolló un algoritmo basado en secuencias para identificar firmas de EMM en epítopos reactivos cruzados.

Principales resultados:

• Las contribuciones conformacionales pueden afectar significativamente la afinidad de unión de proteínas.
• Se identificó el "mimetismo molecular de conjunto" (EMM) como un mecanismo potencial de reactividad cruzada entre proteínas virales y humanas que carecen de similitud/estructura de secuencia.
• Un algoritmo basado en secuencias encontró valores de EMM más altos de lo esperado en 9 de 11 epítopos reactivos cruzados médicamente relevantes.

Conclusiones:

• El equilibrio conformacional juega un papel crucial en la afinidad de unión de proteínas.
• EMM proporciona un marco novedoso para comprender la reactividad cruzada, donde las firmas termodinámicas, no la secuencia/estructura, impulsan el mimetismo.
• Los hallazgos sugieren que EMM es un factor significativo en la reactividad cruzada inmunológica.