Desarrollo de una Plataforma Rápida de Identificación Microbiana de Alta Resolución: Póster Presentado en la...

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• Genómica
• Bioinformática

Sus antecedentes:

• La identificación bacteriana precisa es crucial para garantizar la seguridad de los medicamentos y las vacunas.
• Los métodos genotípicos convencionales a menudo se basan en regiones genómicas limitadas, lo que afecta la resolución y la velocidad de identificación.
• Los avances en las tecnologías de secuenciación de ADN permiten la secuenciación rentable del genoma completo.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un flujo de trabajo rápido para la identificación bacteriana mediante la secuenciación del genoma completo.
• Mejorar la resolución y reducir el tiempo de obtención de resultados para la identificación microbiana en comparación con los métodos convencionales.
• Permitir la diferenciación de alta resolución de cepas bacterianas estrechamente relacionadas.

Principales métodos:

• Se utilizó la secuenciación de ADN de Oxford Nanopore para la secuenciación rápida del genoma completo.
• Se desarrolló un flujo de trabajo para reconstruir secuencias completas del genoma con alta precisión (>99,8%) en comparación con secuencias de referencia.
• Se empleó la asignación taxonómica utilizando la identidad nucleotídica promedio (ANI) y la tipificación de secuencias multilocus para la diferenciación bacteriana.

Principales resultados:

• Se logró la reconstrucción rápida de secuencias completas del genoma bacteriano con alta precisión.
• Se diferenciaron con éxito cepas estrechamente relacionadas de *Shigella* y *E. coli*.
• Se demostró el potencial de diferenciación a nivel de subcepa utilizando el análisis ANI.

Conclusiones:

• La secuenciación del genoma completo ofrece una mayor resolución para la identificación bacteriana.
• El flujo de trabajo desarrollado reduce significativamente el tiempo de obtención de resultados para la identificación microbiana.
• La automatización del análisis de datos, como se ve en la plataforma ViruScreen, agilizará aún más los procesos de identificación microbiana.