Abundancia inusual de los vertebrados 3-fosfato deshidrogenasa pseudogenes

Área de la Ciencia:

• La bioquímica es la bioquímica.
• Biología Molecular Biología Molecular
• Genética evolutiva y genética evolutiva.

Sus antecedentes:

• La gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH) es una enzima crucial en la glucólisis.
• Se conoce un solo gen GAPDH funcional en humanos, ratones, ratas y pollos.
• La localización del gen GAPDH varía, con el cromosoma 12 en humanos y el cromosoma 6 en ratones.

Objetivo del estudio:

• Para investigar la variación del número de copias de las secuencias relacionadas con GAPDH en diferentes especies.
• Para clasificar los organismos basados en el nivel de repetición de los genes GAPDH.
• Para explorar las implicaciones evolutivas de la amplificación del gen GAPDH.

Principales métodos:

• Análisis de manchas de ADN genómico utilizando una sonda de ADNc clonada GAPDH.
• Análisis comparativo de los niveles de repetición de la secuencia GAPDH en varias especies.
• Clasificación de los organismos en grupos basados en el número de copias.

Principales resultados:

• Se observaron diferencias significativas en el número de copias de secuencias relacionadas con GAPDH, que van desde una hasta más de 200 copias.
• Los organismos se clasificaron en tres clases: representación única (pollo), baja repetición (10-30 ejemplares en humanos, liebres, cobayas, hámsters) y alta repetición (>200 ejemplares en ratones, ratas).
• La clase de alta repetición en ratones y ratas representa un hallazgo sin precedentes para los genes codificadores de enzimas.

Conclusiones:

• El estudio revela una divergencia evolutiva sustancial en el tamaño de la familia de genes GAPDH.
• Un importante evento de amplificación génica para secuencias relacionadas con GAPDH probablemente ocurrió hace 15-25 millones de años.
• Esta amplificación extrema en roedores proporciona información sobre la duplicación de genes y la formación de pseudógenos.