La regulación de la estructura de la cromatina del tipo de apareamiento de la levadura por SIR: una acción a...

Área de la Ciencia:

• Genética y epigenética de la levadura.
• Estructura y regulación de la cromatina.
• Mecanismos de silenciamiento de genes.

Sus antecedentes:

• Los alelos del tipo de apareamiento de la levadura (MATa y MAT alfa) regulan la reproducción sexual.
• Los loci de tipo de apareamiento silencioso (HML y HMR) comparten secuencias de ADN con los loci activos, pero están reprimidos transcripcionalmente.
• Se sabe que el complejo Silent Information Regulator (SIR) reprime la transcripción de los loci silenciosos.

Objetivo del estudio:

• Investigar si el SIR regula la estructura general de la cromatina de los loci silenciosos.
• Para comparar la accesibilidad de la cromatina en los loci activos (MAT) frente a los silenciosos (HML / HMR) en presencia y ausencia de SIR.
• Comprender el papel de SIR en la regulación de la interconversión de tipo de apareamiento y la direccionalidad de conmutación.

Principales métodos:

• Ensayos de digestión de nucleótidos utilizando DNAasa I y nucleasa de micrococos.
• Análisis comparativo de los patrones de escisión de la cromatina en las loci HML alfa/MAT alfa y HMRa/MATa.
• Examen de la estructura de la cromatina en las cepas de levadura SIR+ (reprimida) y sir- (desreprimida).

Principales resultados:

• SIR es esencial para establecer y mantener una estructura de cromatina distinta en los loci HM en comparación con los loci MAT.
• SIR induce la desaparición de un sitio específico hipersensible a la DNAasa I en el límite Y-Z en los loci HM.
• Este cambio de cromatina mediado por SIR se correlaciona con la pérdida de un sitio de ruptura de doble hebra, lo que explica el cambio de tipo de apareamiento direccional.

Conclusiones:

• SIR remodela activamente la cromatina en los loci silenciosos, diferenciándolos de los loci activos de tipo de apareamiento.
• La regulación de la estructura de la cromatina por SIR, particularmente el sitio límite Y-Z, es clave para su papel en el silenciamiento de genes.
• Las modificaciones de la cromatina por SIR proporcionan una explicación mecánica para la direccionalidad regulada de la conmutación del tipo de apareamiento de la levadura.