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PDBbrowse - una interfaz gráfica para el Banco de Datos de Proteínas de Brookhaven
D R Stampf1, C E Felder, J L Sussman
1Department of Chemistry, Brookhaven National Laboratory, Upton, New York 11973, USA.
Nature
|April 6, 1995
Resumen
El archivo del Banco de Datos de Proteínas ahora es consultable y visualizable en estaciones de trabajo UNIX. Los usuarios pueden acceder fácilmente y mostrar estructuras de proteínas en 3D con comandos simples.
Área de la Ciencia:
- Biología Estructural Biología estructural.
- La bioinformática es la bioinformática.
- Biología computacional Biología computacional.
Sus antecedentes:
- El Banco de Datos de Proteínas (PDB) es un repositorio crítico para estructuras moleculares tridimensionales determinadas experimentalmente.
- El acceso y la visualización de estructuras complejas de proteínas ha requerido históricamente software especializado y recursos computacionales significativos.
Objetivo del estudio:
- Mejorar la accesibilidad y usabilidad del archivo del Banco de Datos de Proteínas.
- Para permitir una búsqueda y visualización sencilla de las estructuras de proteínas en 3D.
Principales métodos:
- Implementación de una interfaz fácil de usar en estaciones de trabajo UNIX.
- Desarrollo de comandos intuitivos impulsados por pulsación de teclas y ratón para la recuperación y visualización de datos.
Principales resultados:
- Todo el archivo del Banco de Datos de Proteínas ahora está disponible para exploración interactiva.
- Los usuarios pueden buscar de manera eficiente y mostrar estructuras tridimensionales específicas de proteínas.
Conclusiones:
- El acceso simplificado al Banco de Datos de Proteínas facilita la investigación en biología estructural y campos relacionados.
- Este avance reduce la barrera para que los investigadores estudien las estructuras de las proteínas y sus funciones.