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Hélice alfa inducida en el dominio de activación VP16 al unirse a un TAF humano
1Department of Chemistry and Chemical Biology, Harvard University, Cambridge, MA 02138, USA.
Science (New York, N.Y.)
|August 29, 1997
Resumen
El dominio de activación del virus del herpes simple VP16 se transforma en una hélice alfa cuando se une a hTAFII31. Este cambio estructural, impulsado por residuos hidrofóbicos, revela un motivo de reconocimiento para los dominios de activación ácida.
Área de la Ciencia:
- Biología Molecular Biología Molecular
- La bioquímica es la bioquímica.
- Biología Estructural Biología estructural.
Sus antecedentes:
- Los dominios de activación son cruciales para que las proteínas de unión al ADN específicas de la secuencia estimulen la transcripción.
- Los mecanismos estructurales subyacentes a la función del dominio de activación siguen siendo en gran medida desconocidos.
- Comprender estas estructuras es clave para descifrar la regulación génica.
Objetivo del estudio:
- Para aclarar la base estructural de la función de los dominios de activación ácida.
- Investigar la interacción entre el dominio de activación VP16 del virus del herpes simple y su proteína diana hTAFII31.1.
- Para identificar los principios de reconocimiento molecular que rigen esta interacción.
Principales métodos:
- Utilizó una combinación de espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) y experimentos bioquímicos.
- Se analizó la transición estructural del dominio de activación ácida mínima VP16.
- Caracterizó la interfaz de enlace con hTAFII31.1.
Principales resultados:
- El dominio de activación ácida mínima del virus del herpes simplex VP16 se somete a una transición de ajuste inducido de una bobina aleatoria a una estructura helical alfa.
- Este cambio conformacional ocurre al unirse a la proteína diana hTAFII31 (un factor asociado a la proteína de unión a la caja TFIID TATA humana).
- Se identificaron dos residuos hidrofóbicos específicos como críticos para los contactos no polares, lo que sugiere un motivo de reconocimiento conservado.
Conclusiones:
- La función de los dominios de activación ácida está mediada por una estructura alfa helicoidal inducida tras la unión al objetivo.
- Se propone un motivo de reconocimiento general que involucra residuos hidrofóbicos para los dominios de activación ácida que interactúan con hTAFII31.
- Este hallazgo proporciona una visión estructural de los mecanismos de activación de la transcripción.