RPTP LARのタンデムフォスファタゼドメインの結晶構造
1Dana-Farber Cancer Institute and Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA.
ヒトのRPTP LARのタンパク質チロシンフォスファタゼ (PTP) D2ドメインの変異により,触媒活性が可能になる. この発見は,PTPase機能とドメイン指向に関する以前のモデルに異議を唱えている.
科学分野:
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- 構造生物学 構造生物学とは
- 分子生物学は分子生物学である.
背景:
- 受容体型のタンパク質チロシンファスファテーズ (RPTPs) は2つの触媒ドメイン (D1とD2) を有しており,D2ドメインは通常最小限の活性を示しています.
- 人間のRPTP LARの細胞内領域には,構造的および機能的な関係が調査されているタンデムD1およびD2ドメインが含まれています.
研究 の 目的:
- 人間のRPTP LAR.のタンデムD1およびD2ドメインの構造的および機能的特性を調査する.
- D2ドメインの低触媒活性の根拠を特定し,それを高める方法を探求する.
主な方法:
- X線結晶学を用いて,ヒトのRPTP LARのタンデムD1およびD2ドメインの結晶構造を決定した.
- D2ドメイン内の特定のアミノ酸残基を変更するために,サイト指向型変異が採用されました.
主要な成果:
- 結晶構造は,LAR D1とD2ドメインの類似した三次構造を明らかにし,D2の2つの位置で重要な形状の違いがあった.
- D2ドメインのLeu-1644とGlu-1779における突然変異は,重要なタンパク質チロシンフォスファターゼ (PTPase) 活性をもたらした.
- 両ドメインの触媒部位はアクセス可能であることが判明し,以前に提案された二次元ブロックされた指向モデルと矛盾しています.
結論:
- RPTP LARのD2ドメインは,特定の変異によって触媒的に活性化することができる.
- この発見は,D1とD2ドメインが特定の相対的方向性を維持し,ドメイン間相互作用によって安定させられ,解決に潜在的に有利であることを示唆しています.
- この研究は,RPTPにおけるアクセシブルな触媒部位を示し,二次元ブロックされたオリエンテーションモデルを否定している.
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