トランポゾンタグ付けと遺伝子破壊による酵母ゲノムの大規模分析
P Ross-Macdonald1, P S Coelho, T Roemer
1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology, Yale University, New Haven, Connecticut 06520-8103, USA.
Nature
|December 10, 1999
まとめ
研究者は,酵母における大規模な遺伝子機能分析のための費用対効果の高いトランポゾンタグ方法を開発しました. これにより,11,000以上の変異体が生まれ,包括的なゲノム研究が可能になった.
科学分野:
- * ゲノミクスについて
- * 分子生物学 * 分子生物学
- * イースト・ジェネティクス
背景:
- * 経済的で全ゲノムにわたる遺伝子機能分析方法は限られている.
- *トランポゾンタグは,大規模な遺伝子研究のための戦略を提供します.
- *Saccharomyces cerevisiaeは,機能的ゲノミクスにおける重要なモデル生物である.
研究 の 目的:
- *酵母における遺伝子機能の全ゲノム分析のためのトランポゾンタグ戦略を開発し,適用する.
- * 定義された酵母変異体の包括的なコレクションを作成する.
- * 遺伝子破壊フェノタイプ,発現,およびタンパク質の局所化に関する研究を促進する.
主な方法:
- *Saccharomyces cerevisiaeのトランポゾンタグ戦略を開発しました.
- * 11,000以上の酵母変異株のコレクションを生成しました.
- * 20の成長条件における遺伝子破壊のフェノタイプを分析した.
- * 識別された注釈のない開いた読書フレームと分析されたタンパク質の局所化.
主要な成果:
- * 定義された酵母変異菌の最大のコレクション (11,000株以上) を作成しました.
- *挿入は,約2,000の注釈された遺伝子 (全ゲノムの3分の1) に影響した.
- * ~8,000株の破壊フェノタイプが決定されました.
- * 300以上の新しいオープン・リーディングフレームを特定し,1,300のタグされたタンパク質を局所化しました.
結論:
- *開発されたトランポゾンタグ戦略は,大規模酵母機能的ゲノミクスに有効です.
- * 生成された突然変異のコレクションは,酵母研究のための重要なリソースを表しています.
- *この研究は,これまでで最も広範な酵母ゲノム機能分析を提供している.
