アイリッシュ・ジャガイモの飢餓病原体のPCR増幅が,歴史的な標本から得られた

科学分野:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子系遺伝学 分子系遺伝学
• 歴史的植物学 歴史的植物学

背景:

• Phytophthora infestansによって引き起こされた後期病は,ポテトの作物を破壊し,特に1845年のアイルランドのポテト飢饉を引き起こしました.
• 1980年代以前に,Phytophthora infestansの集団は主にUS-1遺伝子型 (IbミトコンドリアDNAハプロタイプ) であり,性繁殖はメキシコに限られていた.

研究 の 目的:

• 1840年代からの歴史的ハーバリウムサンプルにおけるP. infestansの同一性を確認するために.
• P. infestansの祖先株とその初期の流行における役割に関する理論を再評価する.

主な方法:

• 28つの歴史的ハーバリウムサンプル (1845年-1847年) から,内部転写されたスペーサー領域2のDNA増幅とシーケンシング.
• P. infestansのハプロタイプ (Ib, Ia, IIa, IIb) を区別するための変数ミトコンドリアDNA領域の増幅.

主要な成果:

• 1845年から1847年の歴史的なP. infestansのサンプルは,DNA配列解析を用いて確認された.
• これらの歴史的サンプルからの病変は,Ibハプロタイプによって引き起こされず,既存の理論に挑戦しました.
• 現代のIbハプロタイプに存在する変数mtDNA領域は,これらの歴史的サンプルには存在しなかった.

結論:

• US-1遺伝子型 (Ib mtDNAハプロタイプ) は,分析された歴史的サンプルにおける遅い炎症病変の原因ではありませんでした.
• この発見は,祖先のP. infestans株とその歴史上の流行における役割に関する理論の再評価を必要としています.
• 歴史的な標本は,過去の病原体集団と進化史に関する正確な推論に不可欠です.