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Genomic DNA in Eukaryotes00:58

Genomic DNA in Eukaryotes

Eukaryotes have large genomes compared to prokaryotes. To fit their genomes into a cell, eukaryotic DNA is packaged extraordinarily tightly inside the nucleus. To achieve this, DNA is tightly wound around proteins called histones, which are packaged into nucleosomes that are joined by linker DNA and coil into chromatin fibers. Additional fibrous proteins further compact the chromatin, which is recognizable as chromosomes during certain phases of cell division.
Organization of Genes02:07

Organization of Genes

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Complementary DNA01:44

Complementary DNA

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Genomics02:02

Genomics

Genomics is the science of genomes: it is the study of all the genetic material of an organism. In humans, the genome consists of information carried in 23 pairs of chromosomes in the nucleus, as well as mitochondrial DNA. In genomics, both coding and non-coding DNA is sequenced and analyzed. Genomics allows a better understanding of all living things, their evolution, and their diversity. It has a myriad of uses: for example, to build phylogenetic trees, to improve productivity and...
DNA Microarrays02:34

DNA Microarrays

Microarrays are high-throughput and relatively inexpensive assays that can be automated to analyze large quantities of data at a time. They are used in genome-wide studies to compare gene or protein expression under two varied conditions, such as healthy and diseased states. Microarrays consist of glass or silica slides on which probe molecules are covalently attached through surface functionalization. Most commonly, the slides are prepared through the chemisorption of silanes to silica...
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Published on: October 6, 2014

非コーディングRNA遺伝子の計算ゲノミクス

Sean R Eddy1

  • 1Howard Hughes Medical Institute, Department of Genetics, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA. eddy@genetics.wustl.edu

Cell
|May 15, 2002
PubMed
まとめ

非コーディングRNA遺伝子の急速な発見には,高度なコンピューティングゲノミクスが必要です. これらの非コーディングRNA遺伝子の分析は,ゲノミクス研究にとってユニークな計算上の課題を提示します.

科学分野:

  • ゲノミクスゲノミクスとは
  • 分子生物学は分子生物学である.
  • バイオインフォマティックス

背景:

  • 特定されたノンコーディングRNA (ncRNA) 遺伝子の数は急速に増加しています.
  • 計算型ゲノミクスは,タンパク質をコードする遺伝子を分析する上で重要な役割を果たしてきました.
  • ncRNA遺伝子の全範囲を理解することは,ゲノムの完全なイメージを得るために非常に重要です.

研究 の 目的:

  • 非コーディングRNA遺伝子の分析における計算ゲノミクスの応用を探求する.
  • 非コーディングRNAによって引き起こされる特定の計算上の課題を特定する.
  • ncRNA遺伝子発見と分析のための将来の計算戦略の基礎を築く.

主な方法:

  • 現在の計算ゲノミクス技術のレビュー.
  • 非コーディングRNAのユニークな特性の分析.
  • ncRNA分析のための既存の計算ツールにおける限界を特定する.

主要な成果:

  • 非コーディングRNAは,タンパク質をコードする遺伝子とは異なる構造的,機能的特性を有する.
  • 既存の計算方法が直接転送できず,包括的なncRNA分析には不十分である可能性があります.

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Published on: March 1, 2019

  • ncRNAの複雑性と多様性を解決するために,新しい計算手法が必要である.

    • 結論:

    • コンピューティングゲノミクスは,非コーディングRNA遺伝子の研究を進めるための大きな可能性を秘めています.
    • ncRNAのユニークな計算上の課題を克服することは,将来のゲノム研究にとって不可欠です.
    • 効率的なncRNA遺伝子識別と特徴付けのために,専門的な計算ツールの開発がさらに必要である.