古代ハライトから16SリボソームRNA遺伝子の断片を回収

科学分野:

• ゲオミクロバイオロジー
• 分子古生物学は,分子古生物学である.
• 地質化学 地質化学

背景:

• 古代DNA (aDNA) の検出は進歩しているが,非常に古いDNAの主張は依然として論争の的だ.
• 微生物は,地質学的な時間の中で蒸発性堆積物の中で生き残ると仮定されています.
• 蒸発体内の微生物の組み込みの年代は,しばしば不確実である.

研究 の 目的:

• ペトログラフィックおよび地化学的方法を使用して,ハライト蒸発石のサンプルの地質年齢を検証する.
• これらの古代ハライトサンプル内の古代DNA断片を検出し,特徴づけるために.
• 地質学的時間尺度における微生物の生存を調査する.

主な方法:

• ハライトのサンプルをペトログラフィック分析.
• 誘導結合プラズマ質量スペクトロメトリ (LA-ICP-MS) を用いたレーザーアブレーションマイクロプローブによる地化学分析.
• ハライトサンプルからDNA抽出.
• 16SリボソームRNA (rRNA) 遺伝子のポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) 増幅.
• 端末制限断片長ポリモルフィズム (T-RFLP) 分析.

主要な成果:

• 16S rRNA遺伝子のDNA断片は,11~4億2500万年 (Myr) のハライトサンプルから成功裏に増幅されました.
• ハロアーケアの16S rDNAアンプリコンは11~16万年前のサンプルで発見された.
• バクテリアの16S rDNAアンプリコンは,より古いサンプル (65-425 Myr) で検出されました.
• T-RFLP分析により,様々な年齢のハリト族に多種多様な微生物集団または自由DNAが発見されました.

結論:

• この研究は,ハライト蒸発体内の古代DNAの存在に対する確固たる証拠を提供し,DNA保存の既知の限界を広げています.
• この発見は,蒸発堆積物の中で地質学的な時間における微生物の生存の仮説を裏付けている.
• 地化学的および分子的テクニックを組み合わせて,古代サンプルの年齢と生物学的含有量を検証することができます.