900KのGroEL GroES複合体のNMR分析
Jocelyne Fiaux1, Eric B Bertelsen, Arthur L Horwich
1Institut für Molekularbiologie und Biophysik, Eidgenössische Technische Hochschule Zürich, CH-8093 Zürich, Switzerland.
Nature
|July 12, 2002
まとめ
核磁気共鳴 (NMR) スペクトロスコピーは,以前のサイズ制限を克服し,最大900Kの大きなバイオ分子複合体を分析することができます. 新しい技術は,これらの巨大な構造におけるタンパク質の構造,動力学,相互作用の詳細な研究を可能にします.
科学分野:
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- 構造生物学 構造生物学とは
- バイオフィジックス 生物物理学
背景:
- 溶液核磁共振 (Solution Nuclear Magnetic Resonance,NMR) スペクトロスコピーは,通常10万個までの相対分子量 (M(r)) のバイオ分子構造の分析に限定されています.
- より大きな複合体は,急速な横断リラクゼーションを経験し,NMRスペクトルを著しく悪化させ,分析を妨げます.
- GroELやGroESのようなバクテリアのチャペロニンは,タンパク質の折り畳みに不可欠な大きなマクロ分子複合体です.
研究 の 目的:
- 100KMを超える生物分子複合体を分析するための高度なNMR技術を開発し,実証する.
- チャペロニンGroELと結合すると,コチャペロニンGroESの構造的および動的変化を調査する.
主な方法:
- トランスバース・リラクゼーション・オプティマイズド・スペクトロスコーピー (TROSY) とクロス・コレレート・リラクゼーション・エンハンスド・ポラライゼーション・トランスファー (CP) を利用した.
- GroEL (800K M(r)) と GroELの変種 (SR1,400K M(r)) と複合した同位体ラベル GroES (72K M(r)) にこれらのテクニックを適用しました.
主要な成果:
- チャペロニン複合体から高品質のNMRスペクトルを900KMまで記録しました.
- GroELと結合すると,GroESの残留物17-32の有意な化学的シフト変化が観察され,このループ領域の動態が変化したことを示しています.
- ほとんどのGroES残基は,自由または結合のいずれであっても,類似の共鳴を維持し,局所的な相互作用によって引き起こされる変化を強調することを実証しました.
結論:
- 先進的なNMR技術は,大型分子の急速な横断リラクゼーションによって引き起こされるスペクトル悪化を効果的に克服します.
- これらの方法により,以前は溶液NMRにアクセスできない大規模なマクロ分子複合体内の構造,動力学,相互作用の探査が可能になります.
- この研究は,GroES-GroEL複合体の結合インターフェースと構成の柔軟性についての洞察を提供します.
関連する概念動画
NMR Spectrometers: Overview
NMR spectrometers consist of a strong magnet, a radiofrequency transmitter, and a detector attached to a computer console for recording spectra of samples containing NMR-active nuclei. In first-generation NMR instruments called continuous-wave spectrometers, the resonance frequencies of the nuclei are determined by frequency-sweep or field-sweep methods. The magnetic field strength is fixed and the rf signal is swept in the former, while the radiofrequency signal is fixed and the magnetic field...
¹H NMR: Complex Splitting
A proton M that is coupled to a proton X results in doublet signals for M. However, NMR-active nuclei can be simultaneously coupled to more than one nonequivalent nucleus. When M is coupled to a second proton A, such as in styrene oxide, each peak in the doublet is split into another doublet.
Splitting diagrams or splitting tree diagrams are routinely used to depict such complex couplings. While drawing splitting diagrams, the splitting with the larger coupling constant is usually applied first.
Splitting diagrams or splitting tree diagrams are routinely used to depict such complex couplings. While drawing splitting diagrams, the splitting with the larger coupling constant is usually applied first.
Applications Of NMR In Biology
Nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy is a very valuable analytical technique for researchers. It has been used for more than 50 years as an analytical tool. F. Bloch and E. Purcell formulated NMR in 1946 and won the 1952 Nobel Prize in Physics for their work. Biological macromolecules such as proteins, nucleic acids, lipids, and organic molecules including pharmaceutical compounds, can be studied using this versatile tool that exploits the magnetic properties of certain nuclei.
The...
The...
NMR Spectroscopy Of Amines
In proton NMR spectroscopy, primary amines and secondary amines showcase their N–H protons as a broad signal in the chemical shift range between δ 0.5 and 5 ppm. The exact position in this range depends on several factors, including sample concentration, hydrogen bonding, and the type of solvent used. Since amine protons undergo fast proton exchange in solution, the protons are labile and therefore do not participate in any splitting with adjacent protons. Thus, the observed peak is broad and...


