活動性に基づくタンパク質プロファイリング in vivo 銅 (((i) 触媒化アジドアルキン [3 + 2] サイクル添加を用いて
Anna E Speers1, Gregory C Adam, Benjamin F Cravatt
1The Skaggs Institute for Chemical Biology, Departments of Chemistry, The Scripps Research Institute, 10550 North Torrey Pines Road, La Jolla, California 92037, USA.
Journal of the American Chemical Society
|April 17, 2003
まとめ
この研究では,細胞内の活性酵素を標識し検出するために,クリック化学を用いた新しい活動ベースのタンパク質プロファイリング (ABPP) 方法が導入されています. この高度なテクニックは,よりよいタンパク質機能割り当てのための機能性タンパク質分析を可能にします.
科学分野:
- プロテオミクス プロテオミクスは,プロテオミクスの
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- 分子生物学は分子生物学である.
背景:
- ゲノムによってコードされたタンパク質に機能を割り当てることは,プロテオミクスにおける重要な課題です.
- 細胞内のタンパク質の機能を特徴付けるには,翻訳後の改変と調節因子を考慮する技術が必要です.
研究 の 目的:
- 活性ベースのタンパク質プロファイリング (ABPP) のための高度な戦略を開発し,タンパク質をin vivoで機能的に特徴づける.
- 複雑な細胞環境内の活性酵素の検出を可能にします.
主な方法:
- アジド硫酸エステルプローブを使用して,酵素の活性ベースのラベリングをインビトロおよびインビボで行いました.
- 標識されたタンパク質の検出のために,ロダミン-アルキン反応剤による銅触媒結合を用いた.
- 機能性プロテオーム分析のための応用クリック化学.
主要な成果:
- アジド-スルフォナートエステルプローブを使用して,いくつかの酵素の活性ベースのラベリングが成功していることが実証されました.
- プロテオーム全体でこれらのラベリングイベントの検出を披露しました.
- クリック化学ベースのABPP戦略の有効性を検証しました.
結論:
- 開発されたクリック化学ベースのABPP戦略は,機能性タンパク質分析のための多用途な方法です.
- このアプローチにより,多数のタンパク質製品に機能を割り当てることが容易になります.
- ダイナミックな細胞環境におけるタンパク質活性の研究のための新しいツールを提供します.
