ネズミとマウスの分岐以来,複数のアミノ酸の置換部位でのポジティブな選択
Georgii A Bazykin1, Fyodor A Kondrashov, Aleksey Y Ogurtsov
1Department of Ecology and Evolutionary Biology, Princeton University, Princeton, New Jersey 08544, USA. gbazykin@princeton.edu
ポジティブ・セレクションは,アミノ酸の急速な交換を促し,同じ進化の系統でしばしば複数の突然変異が起こる. これは,多くの場所でのポジティブな選択が作用し,遺伝的進化に影響を及ぼすことを示唆しています.
科学分野:
- 進化生物学の進化生物学について
- 分子進化は分子進化である.
- ゲノミクスゲノミクスとは
背景:
- アレル固定は,遺伝的漂移または陽性選択によって起こる.
- 固定における選択の正確な役割については,依然として議論されている.
- 固定メカニズムを理解することは,進化の洞察の鍵です.
研究 の 目的:
- 哺乳類およびプロカリオットのゲノムにおける非同義的な置換のパターンを調査する.
- ポジティブ・セレクションが,どの程度,アミノ酸の急速な交換を促すかを判断する.
- アレル固定における選択と中性漂移を区別する.
主な方法:
- ネズミとマウスの遺伝子の比較ゲノム分析 (9,390遺伝子).
- 種間の2つまたは3つのヌクレオチドの違いを持つコドンの分析.
- 12組のプロカリオットゲノムにおける置換パターンの検討.
主要な成果:
- 同じコドンで複数の非同義の置換が同じ系統で発生したのは,偶然によって予想されるよりも頻繁に発生した (64%が2つの置換で,46%が3つの置換).
- この"集積"パターンは,プロカリオットのゲノムでも観察されました.
- 観察されたパターンは中性漂移または相関変異と矛盾しています.
結論:
- この発見は,ポジティブ・セレクションが,次々にアミノ酸の置換を頻繁に誘導することを強く示唆している.
- 急速で連続したアミノ酸の置換は,ポジティブな選択の一般的な結果である.
- これは,ゲノム形成におけるポジティブ・セレクションの重要な役割の証拠である.
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