ピロロール-イミダゾールS-CBIコンジュガートによるエナンチオセレクティブDNAアルキレーション
Toshikazu Bando1, Akihiko Narita, Ken Asada
1Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyoto University, Sakyo, Kyoto 606-8501, Japan.
Journal of the American Chemical Society
|July 22, 2004
まとめ
N-メチルピロール (Py) -N-メチリミダゾール (Im) ポリアミドとサイクロプロパベンジンドール (CBI) が合成されました. 12Sエナチオメールは選択的にアルキル化DNAを誘導し,CPI結合体よりも高い効率を示し,12Rは弱かった.
科学分野:
- 薬用化学 薬用化学について
- オーガニック・シンセシス オーガニック・シンセシス
- 分子生物学は分子生物学である.
背景:
- ヘアピンポリアミドは,治療的可能性のあるDNA結合分子です.
- N-メチルピロール (Py) -N-メチリミダゾール (Im) ポリアミドは,DNA結合剤の一種である.
- サイクロプロパベンジンドール (Cyclopropabenzindole,CBI) は,DNAをアルキル化する分子である.
研究 の 目的:
- CBIエナチオマーと結合したPy-ImポリアミドのDNAアルキル化活性を合成および評価する.
- 異なるエナティオマーおよび関連する化合物のDNAアルキル化選択性と効率を比較する.
主な方法:
- Py-ImヘアピンポリアミドをCBIの12Sおよび12Rエナントイオマーと結合した合成.
- DNAアルキル化を評価するための高解像度デナチュレーションゲル電泳.
- 合成デカヌクレオチドの製品分析.
主要な成果:
- 12SエナチオメールはDNA断片の5'-TGACCA-3'配列を選択的かつ効率的にアルキル化します.
- 12Sは,サイクロプロパピロインドール (CPI) 結合物11と比較して,より高い選択性と効率性を示した.
- 12Rエナチオメールは,非常に弱いDNAアルキル化活性を示した.
- 12Sは12Rよりも有意に高い反応性を示した.
結論:
- エナチオセレクティブDNAアルキレーションは,CBIユニットのサイクロプロパンリングがDNAマイナー・グリューブの方向性に起因する.
- CBIユニットの1,3-ナフタレンディオールからのアクセシビリティは,大規模合成の可能性を示唆しています.
- これらの発見は,将来の動物研究のためのアルキル化Py-Imポリアミドの開発を支援します.
