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Gene Conversion

Other than maintaining genome stability via DNA repair, homologous recombination plays an important role in diversifying the genome. In fact, the recombination of sequences forms the molecular basis of genomic evolution. Random and non-random permutations of genomic sequences create a library of new amalgamated sequences. These newly formed genomes can determine the fitness and survival of cells. In bacteria, homologous and non-homologous types of recombination lead to the evolution of new...
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DNA-only Transposons

DNA-only transposons are called autonomous transposons since they code for the enzyme transposase that is required for the transposition mechanism. Insertion of transposons can alter gene functions in multiple ways. They can mutate the gene, alter gene expression by introducing a novel promoter or insulator sequence, introduce new splice sites, and change the mRNA transcripts produced, or remodel chromatin structure.
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Conservative Site-specific Recombination and Phase Variation

Because the DNA segments are cut and reorganized in a direction-specific manner, site-specific recombination has emerged as an efficient genetic engineering technique. Flippase and Cyclization recombinases or Flp and Cre, respectively, are two members of the tyrosine recombinase family derived from bacteriophages, that are used to mediate site-specific DNA insertions, deletions, and targeted expression of proteins in mammalian cell lines.
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Maxam-Gilbert Sequencing

In the same year as the discovery of the Sanger sequencing method, another group of scientists, Allan Maxam and Walter Gilbert, demonstrated their chemical-cleavage method for DNA sequencing. The Maxam-Gilbert method relies on using different chemicals that can cleave the DNA sequence at specific sites, the separation of resulting DNA fragments of variable size using electrophoresis, and deciphering the DNA sequence from the resulting gel bands.
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Electroeluting DNA Fragments

Published on: September 5, 2010

アロマティックアミンによる二重DNAへの還元性電子の注入.

Takeo Ito1, Steven E Rokita

  • 1Department of Chemistry and Biochemistry, University of Maryland, College Park, MD 20742, USA.

Journal of the American Chemical Society
|November 26, 2004
PubMed
まとめ

研究者らは,DNAの電荷移転のためにアロマティックアミンをスクリーニングするための新しい測定法を開発しました. N,N,N,N,N でした.

科学分野:

  • バイオケミストリー バイオケミストリー
  • 分子生物学は分子生物学である.
  • フォトケミストリー フォトケミストリー

背景:

  • アロマティックアミンはDNAの電荷移転を開始し,DNAの損傷と修復に関連するプロセスである.
  • これらの化合物をスクリーニングし,電荷移転メカニズムを理解するためにアッセイを開発することは極めて重要です.
  • これまでの方法では,DNA内の電子伝送の複雑さを探求するための感度が欠けていました.

研究 の 目的:

  • 還元性電子ドナーによるDNAの電荷移転を開始できるアロマティックアミンをスクリーニングするための新しい測定法を開発する.
  • 設計されたオリゴデオキシヌクレオチド-TMDN結合体を使用して,DNA内の電子注入と転送の効率に影響を与える要因を調査する.
  • DNAの電荷移転を調節する核塩基同一性の役割を明らかにする.

主な方法:

  • ブロモデオキシウリジン ((Br) U) 残留と低塩基部位を有するDNAを用いた光誘発反応分析を開発した.
  • アロマティックアミンは,電荷移転を開始する能力のためにスクリーニングされました.
  • 電子伝送効率に影響を与える変数を研究するために,オリゴデオキシヌクレオチド-TMDN結合体を準備しました.

主要な成果:

  • 活性化合物としてN,N,N',N'-テトラメチル-1,5-ダイアミノナフタレン (TMDN) と1,5-ダイアミノナフタレン (DAN) を特定した.

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  • 測定は酸素に対する軽度の感受性を示したが,2-マーカプトエタノールによる有意な阻害を示した.
  • 核塩基同一性は電荷伝送を強く調節し,アデニン (A) がTMDNの対塩基としてサイトシン (C) に置き換えられたときに60倍の減少が観察されました.
  • (Br) Uの減少と対基によるTMDN光消しとの間には,逆相関がみられ,これは,急性再結合と電子移動の間の競争を示唆している.

    • 結論:

    • 開発されたアッセイは,DNAチャージ転送の開始のためにアロマティックアミンを効果的にスクリーニングします.
    • 核塩基同一性は,DNA内の電荷伝送効率の決定的な決定因子である.
    • この発見は,電子の移動がDNAの電荷移転プロセスにおける根幹再結合と競合するモデルを裏付けている.