マイクロアレイによる癌の予測:複数のランダム検証戦略

科学分野:

• 腫瘍学 腫瘍学
• バイオインフォマティクス
• ゲノミクスゲノミクスとは

背景:

• DNAマイクロアレイを用いた遺伝子発現プロファイリングは,がんの予後を予測することを目的としています.
• 分子シグネチャーの識別は,疾患の重症度に基づいて,がん治療をパーソナライズすることができます.

研究 の 目的:

• DNAマイクロアレイを用いてがんの予後を予測する7つの大規模な研究から得られたデータを再分析する.
• 分子シグネチャーの安定性と分類の精度を評価する.

主な方法:

• 複数のランダムトレーニングおよび検証セットを使用して,標準戦略を拡張しました.
• 識別された分子シグネチャーの安定性とその誤分類率を評価した.

主要な成果:

• 癌の予後のための分子シグネチャーは非常に不安定で,トレーニングセットの組成に依存していました.
• ほとんどの研究では,妥当性のない検証により,過剰な楽観的な結果が示されましたが,7件のうち5件では,偶然以上の結果が得られませんでした.
• 誤った分類率は,より大きなトレーニングセットのサイズで一般的に減少しました.

結論:

• がんにおける公表されたDNAマイクロアレイの研究の予後的価値は,慎重に解釈されるべきである.
• 信頼性を確保するために,繰り返しランダムサンプリングによる検証が推奨されます.