類人猿の泡状ウイルスと霊長類の古代共同種化
William M Switzer1, Marco Salemi, Vedapuri Shanmugam
1HIV and Retrovirology Branch, Division of HIV/AIDS Prevention, National Center for HIV, STD, and TB Prevention, Centers for Disease Control and Prevention, 1600 Clifton Road, MS G-19, Atlanta, Georgia 30333, USA. bis3@cdc.gov
類人猿の泡状ウイルス (SFV) は,旧世界の霊長類と共種化し,長期のウイルス-宿主共種化の珍しい証拠を提供しました. これらの古代のRNAウイルスは,非常にゆっくりと進化し,3,000万年の共通の歴史を示唆しています.
科学分野:
- ウイルス学 ウイルス学 ウイルス学
- 進化生物学の進化生物学について
- 霊長類の遺伝学
背景:
- 寄生虫と宿主の同時進化である共種化 (コスペシエーション) は,仮説を立てられたが,めったに確認されていない進化パターンである.
- RNAウイルスは通常,急速な進化と頻度の高い種間感染を示し,共同種化が珍しい.
- 類人猿の泡状ウイルス (SFV) は,すべての霊長類に感染する広範囲に広がった非病原性レトロウイルスです.
研究 の 目的:
- 類人猿の泡状ウイルス (SFV) とその霊長類宿主との共同種化仮説を検証する.
- SFVとその霊長類宿主の進化史と分岐時間を決定する.
- 他のRNAウイルスと比較してSFVの進化速度を評価する.
主な方法:
- SFVポリメラーゼと霊長類ミトコンドリアサイトクローム酸化酵素II (COII) サブユニットII (COII) 遺伝子の比較的な系統遺伝分析.
- 分子時計の校正を用いて,分岐時間と進化速度を推定した.
- アフリカとアジアの猿と類人猿から得られたウイルスと宿主遺伝子のデータを分析した.
主要な成果:
- SFVとその霊長類宿主の系統樹は,分岐順序と分岐時間において顕著な一致を示した.
- 分子時計の分析により,SFVの進化率は極めて低いことが明らかになった (年間1箇所あたり1.7×10^-8の置換).
- SFVは,これまで文書化されている中で最もゆっくりと進化するRNAウイルスの1つとして特定されました.
結論:
- 同類の系統は,SFVと旧世界の霊長類の間の長期的な共同種化イベントを強く支持しています.
- SFVは,少なくとも3000万年に及ぶ共通の進化の歴史を持つ,最も古い脊椎動物RNAウイルスを代表する可能性があります.
- SFVの遅い進化率は,長期間,霊長類宿主との関連と共同種化を促進する.
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