10人のヒト染色体の5核性otide解像度のトランスクリプションマップです
Jill Cheng1, Philipp Kapranov, Jorg Drenkow
1Affymetrix Inc., Santa Clara, CA 95051, USA.
まとめ
無注釈,非ポリアデニル化トランスクリプトは,ヒトゲノムの主要な出力である. これらは,ポリアデニル化トランスクリプトとともに,遺伝子調節と遺伝子型-フェノタイプ関連に影響を与える複雑なネットワークを形成します.
科学分野:
- ゲノミクスゲノミクスとは
- 分子生物学は分子生物学である.
- トランスクリプトミクス (Transcriptomics) とは
背景:
- 人間のゲノムの転写出力は複雑で,完全に理解されていない.
- RNAトランスクリプトの全スペクトルの特徴づけは,ゲノム機能を理解するために重要である.
研究 の 目的:
- ヒト染色体におけるポリアデニル化および非ポリアデニル化RNA転写の正確な位置をマッピングする.
- ヒトゲノムにおける異なるトランスクリプト型 (ポリアデニル化,非ポリアデニル化,バイモルフィック) の割合を定量化する.
- 転写された配列の核の局所化とアノテーション状態を調査する.
主な方法:
- RNA転写部位の高解像度 (5塩基対) マッピング.
- 8つの異なる細胞系における10人のヒト染色体の分析.
- ポリアデニレーション状態と注釈に基づくトランスクリプトの分類.
主要な成果:
- 無注釈,非ポリアデニル化トランスクリプトは,ヒトゲノムのトランスクリプション出力の最大の部分を構成しています.
- ポリアデニル化,非ポリアデニル化,およびバイモルフィックトランスクリプトは,それぞれ,すべてのトランスクリプトされた配列の19.4%,43.7%,および36.9%を占めました.
- 転写された配列の約半分は核であり,大部分は注釈されていない.
結論:
- 人間のゲノムのトランスクリプトされた領域は,注釈と注釈のないトランスクリプトの複雑で絡み合ったネットワークです.
- この複雑な組織は,遺伝子発現の調節を理解する上で重要な意味を持つ.
- これらの発見は,遺伝子型-フェノタイプ関連の再評価と遺伝子の根本的な定義を必要とします.


