S. cerevisiaeにおけるニュクレオソームの位置をゲノムスケールで特定する

科学分野:

• 分子生物学は分子生物学である.
• ゲノミクスゲノミクスとは
• エピジェネティクス エピジェネティクス

背景:

• 核子の位置づけは,真核生物の遺伝子発現の調節に極めて重要です.
• 核個体へのDNA包装は,配列のアクセシビリティに影響する.
• クロマチンの組織を理解することは,遺伝子調節を解読する鍵です.

研究 の 目的:

• Saccharomyces cerevisiaeのゲノムの大部分にわたって,高解像度で核細胞の位置をマッピングする.
• ヌクレオソームの位置づけとプロモーターなどの規制要素の関係を調査する.
• 転写因子の結合を制御するニュクレオソームの位置づけの役割を決定する.

主な方法:

• 高解像度タイルのマイクロアレイのアプローチの開発.
• ニュクレオソームの翻訳位置の全ゲノムマッピング.
• 染色体IIIと規制領域を中心に,Saccharomyces cerevisiaeの染色体組織の分析.

主要な成果:

• 酵母DNAの482キロベースに2278個の位置の良い核細胞を特定しました.
• Pol II プロモーターで保存されたクロマチンの構造を発見:スタートコドンの上流にある,位置づけられたヌクレオソームに囲まれたヌクレオソームフリー領域.
• ヌクレオソームフリー領域は進化的に保存され,ポリ-dA/dT配列で濃縮されていることが観察されました.
• 転写因子結合モチーフは,大部分がヌクレオソームフリーであり,ヌクレオソームの位置がアクセスの決定因子であることを示しています.

結論:

• 核子の位置づけは,遺伝子発現を調節する主要な要因です.
• ステレオタイプ化されたクロマチンの組織が酵母プロモーターに存在し,転写因子のアクセシビリティに影響を与えます.
• 核子の位置づけは,DNAモチーフへの転写因子のアクセスを決定する上でグローバルな役割を果たします.