エストロゲン受容体結合の染色体幅のマッピングは,フォークヘッドタンパク質FoxA1を必要とする長距離調節を明らかにします
Jason S Carroll1, X Shirley Liu, Alexander S Brodsky
1Department of Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School, 44 Binney Street, Boston, Massachusetts 02115, USA.
エストロゲン受容体 (ER) の結合部位は,ヒト染色体にマッピングされた. 直接的なER結合には,乳がんにおけるエストロゲン誘発遺伝子発現に不可欠なフォークヘッド因子FoxA1が必要です.
科学分野:
- ゲノミクスゲノミクスとは
- 分子生物学は分子生物学である.
- がん研究 がん研究
背景:
- エストロゲンは生殖と乳がんにおいて極めて重要です.
- 遺伝子のシス調節要素の理解は限られている.
- エストロゲン受容体 (ER) の機能は乳がんの鍵です.
研究 の 目的:
- ヒト染色体21と22のER結合部位をマップする.
- cis規制要素の組織を調査する.
- ER染色体結合と遺伝子調節に必要な要因を特定する.
主な方法:
- クロマチン免疫プレシピテーション (ChIP) とタイルのマイクロアレイを組み合わせた.
- ER関連性の全ゲノムマッピング.
- FoxA1のノックダウン後の遺伝子発現分析.
主要な成果:
- ERは選択的に特定の部位に結合し,しばしば遺伝子の開始部位から遠く離れている.
- 直接的なER結合は,フォークヘッド因子結合部位の近くを必要とします.
- FoxA1ノックダウンは,ER染色体結合とエストロゲン誘発遺伝子発現を阻害する.
結論:
- FoxA1は,乳がん細胞におけるエストロゲン反応を媒介するために不可欠です.
- ERがクロマチンと結合することは,他の転写因子によって調節されます.
- この研究は,ER機能のゲノム組織に関する洞察を提供します.
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