マウスの臓器および臓器細胞のタンパク質発現に関する世界規模調査: プロテオミクおよびトランスクリプトミクプロファイルの組み合わせ

科学分野:

• プロテオミクス プロテオミクスは,プロテオミクスの
• 細胞生物学 細胞生物学
• 哺乳類システム生物学 哺乳類システム生物学

背景:

• 哺乳類の臓器と臓器細胞のタンパク質組成を理解することは,生物学的システムを解読する上で極めて重要です.
• 細胞内のタンパク質の多様性と局所に関する知識には大きなギャップがある.

研究 の 目的:

• マウスの6つの主要な臓器の主要な臓器細胞区画のプロテオームを包括的にマッピングする.
• 特定されたタンパク質の細胞下部位と組織特異的発現を決定する.
• 哺乳類の組織と臓器タンパク質の検索可能な要約を作成する.

主な方法:

• サブセルラー分断は,異なる臓器細胞区画 (細胞溶液,膜,ミトコンドリア,核) を分離するために行われます.
• タンデム質量スペクトロメトリーベースのショットガンプロテオミクスを使って,徹底したタンパク質の識別を行う.
• 統計的フィルタリングと機械学習により,高信頼性のサブセルラー局所決定を行う.
• 組織選択性を評価するためにmRNA発現データとの比較.

主要な成果:

• マウスの6つの臓器と4つの主要なサブセルラーコンパートメントにわたる4768のタンパク質の識別.
• 3,274のタンパク質に対して,以前は特徴づけられなかった1,503の因子を含めて,高信頼性局所化が決定されました.
• 組織特異のタンパク質発現パターンの評価.

結論:

• この研究は,マウス組織とオルゲネルのタンパク質の高解像度分子アトラスを提供しています.
• 生成された要約は,哺乳類の細胞生物学と疾患の研究のための基礎的参考文献として機能します.
• アクセシブルなウェブブラウザインターフェースは,タンパク質の機能と局所化のさらなる探索と発見を容易にする.