転写ゲノミクスは,FOX転写因子をヒトの心不全と関連付けています

科学分野:

• 心血管生物学 心血管生物学
• 分子遺伝学 分子遺伝学
• ゲノミクスゲノミクスとは

背景:

• 転写因子 (TFs) は,ネズミの心不全モデルにおける心臓遺伝子発現を調節する.
• 人間の心不全におけるこれらのTFの関連性は,以前調査されていませんでした.

研究 の 目的:

• 特定の心臓TFがヒトの心不全と関連しているという仮説を,計算的アプローチを用いて検証する.
• 人間の心不全の病原性に関与する新しいTFを特定する.

主な方法:

• 失敗した (n=196) と失敗しない (n=16) 人間の心臓からのRNA分離に適用されたトランスクリプションゲノミクス.
• 差異的に発現する遺伝子のプロモーター領域におけるTF結合部位の分析.
• ネズミの心不全モデルで特定されたTFと比較.

主要な成果:

• MEF2,NKX,NF-AT,およびGATA TFsの結合部位は,ヒトの心不全遺伝子 (P<0.002) で著しく過剰に表現されていた.
• FOX TF結合部位は,ヒトとネズミの両方の心不全において過剰に存在していた (P<0.002).
• 発現分析は,人間の心筋細胞の機能不全におけるFOXC1,C2,P1,P4,およびO1Aと,核におけるFOXP1を確認した.

結論:

• MEF2,NKX,NFAT,およびGATA TFsをヒトの心不全と結びつける最初の証拠を提供します.
• FOXファミリーのTFs (FOXC1,C2,P1,P4,O1A) が心不全の病原性に関与している.
• 動物モデルとヒトの心不全との関連を確立し,FOX信号がストレスに対する心筋縮反応における役割を示唆しています.